RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 SLURP1P55000 103 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ATAD3CQ5T2N8 411 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 AMIGO2Q86SJ2 522 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 PARP16Q8N5Y8 322 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 GNG12Q9UBI6 72 aa21.21■□□□□ 0.99
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP6V0E1O15342 81 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PPIFP30405 207 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OR10V1Q8NGI7 309 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LYSTQ99698 3801 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GABARAPL3Q9BY60 117 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ING4Q9UNL4 249 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 STARD9Q9P2P6 4700 aa21.2■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAV41A0A0B4J266 112 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LDLRAD4O15165 306 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CDRT1O95170 752 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 FASP25445 335 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB9AP51151 201 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ACBD7Q8N6N7 88 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51A2Q8NGJ7 313 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ARPC1AQ92747 370 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OR51J1Q9H342 316 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SORL1Q92673 2214 aa21.19■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC01619G3V211 115 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 AIPO00170 330 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ORC5O43913 435 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 CSTBP04080 98 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 RBM11P57052 281 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OR5AK2Q8NH90 309 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TM2D3Q9BRN9 247 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 METTL9Q9H1A3 318 aa21.18■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM212A6NML5 194 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 IGLV1-40P01703 118 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 RPSAP08865 295 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LSAMPQ13449 338 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 Q3ZCU0 254 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PRR18Q8N4B5 295 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 STX19Q8N4C7 294 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OR52N1Q8NH53 320 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ALG8Q9BVK2 526 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TAS2R4Q9NYW5 299 aa21.17■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 J3QRE1 110 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINT2O43291 252 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SOX2P48431 317 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 PITPNAQ00169 270 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 GALEQ14376 348 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OR4C12Q96R67 309 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 S100A13Q99584 98 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF251Q9BRH9 671 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 IFT22Q9H7X7 185 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB9BQ9NP90 201 aa21.16■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 OR8U9P0C7N5 309 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 SERPINA2P20848 420 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF137PP52743 207 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 ECSCRQ19T08 205 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 LHFPL3Q86UP9 236 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 EDA2RQ9HAV5 297 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa21.15■□□□□ 0.98
CAPNS1-217ENST00000629983 MT-ND4P03905 459 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ACTBP60709 375 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CT45A1Q5HYN5 189 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ACSM6Q6P461 480 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ASCL4Q6XD76 172 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF439Q8NDP4 499 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CT45A3Q8NHU0 189 aa21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A087WW49 117 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 C12orf77C9JDV5 145 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 HLA-DRB1P01911 266 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CNTFRP26992 372 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 VHLP40337 213 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF134P52741 427 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 NHLRC3Q5JS37 347 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF497Q6ZNH5 498 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LINC00596Q86U02 117 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 HAPLN4Q86UW8 402 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 SGPP2Q8IWX5 399 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD60Q9BZ19 345 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 ERGIC3Q9Y282 383 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 AP4S1Q9Y587 144 aa21.13■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 A0A1W2PN81 502 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM90A10PA6NDY2 464 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LANCL1O43813 399 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 JTBO76095 146 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRNA7P36544 502 aa21.12■□□□□ 0.97
CAPNS1-217ENST00000629983 MPV17LQ2QL34 196 aa21.12■□□□□ 0.97
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