RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000612509.4

SEMA3B-211, Transcript of semaphorin 3B, humanhuman

TSL 5

Gene SEMA3B, Length 1,061 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3B-211ENST00000612509 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TSPAN9O75954 239 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CEACAM3P40198 252 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RANBP1P43487 201 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 SHISA2Q6UWI4 295 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 C16orf95Q9H693 158 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RAB9BQ9NP90 201 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.55□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LY6LH3BQJ8 138 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LDLRAD4O15165 306 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RAB3BP20337 219 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 ARHGDIBP52566 201 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TMEM219Q86XT9 240 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OR4C13Q8NGP0 309 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TOMM40LQ969M1 308 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RPEQ96AT9 228 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 PITPNC1Q9UKF7 332 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RNF114Q9Y508 228 aa14.54□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 A0A1W2PPE3 182 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 IFITM5A6NNB3 132 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OOSP1A8MZH6 123 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 SPINT2O43291 252 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 HBZP02008 142 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 LOXL3P58215 753 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 PRR18Q8N4B5 295 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 OR1L1Q8NH94 360 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 FAAP24Q9BTP7 215 aa14.53□□□□□ -0.08
SEMA3B-211ENST00000612509 SOCS1O15524 211 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 TNFAIP8O95379 198 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 PROK1P58294 105 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 PLA2G7Q13093 441 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 MADCAM1Q13477 382 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 C2orf76Q3KRA6 126 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF554Q86TJ5 538 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 NR2C2APQ86WQ0 139 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 FAM89BQ8N5H3 189 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 OR10X1Q8NGY0 326 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 OR51E2Q9H255 320 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 GNG12Q9UBI6 72 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 SSR3Q9UNL2 185 aa14.52□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 SMIM30A4D0T7 59 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 RRP9O43818 475 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 BRS3P32247 399 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 MNDAP41218 407 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 VEGFCP49767 419 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 HMGN3Q15651 99 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 Q3ZCU0 254 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 LINC00311Q8N616 119 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 LIN7BQ9HAP6 207 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.51□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 A0A0B4J203 849 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 A0A1W2PPI3 338 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 HSD17B6O14756 317 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 NAPSAO96009 420 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 CD36P16671 472 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 GADD45AP24522 165 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 CD24P25063 80 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 FBLN7Q53RD9 439 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 Q6ZPA2 131 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 MOB1BQ7L9L4 216 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 TSPAN14Q8NG11 270 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 OR56B1Q8NGI3 324 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 ZNF702PQ9H963 129 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 AK3Q9UIJ7 227 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 RAB22AQ9UL26 194 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 HSF4Q9ULV5 492 aa14.5□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 A0A087WXM4 84 aa14.49□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 NOTOA8MTQ0 251 aa14.49□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 TIMM23O14925 209 aa14.49□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 SLC31A2O15432 143 aa14.49□□□□□ -0.09
SEMA3B-211ENST00000612509 KIR2DS4P43632 304 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms