RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597316.1

TRPM4-208, Transcript of transient receptor potential cation channel subfamily M member 4, human

TSL 3

Gene TRPM4, Length 780 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRPM4-208	ENST00000597316	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ACBD7	Q8N6N7	88 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	OR6Q1	Q8NGQ2	317 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	UBALD1	Q8TB05	177 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	TRUB1	Q8WWH5	349 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ISOC1	Q96CN7	298 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	MRPL48	Q96GC5	212 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	MYCBP	Q99417	103 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	GABARAPL3	Q9BY60	117 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	FAM192A	Q9GZU8	254 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	IFT22	Q9H7X7	185 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316		G3V318	75 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	IGLV1-40	P01703	118 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	MYF6	P23409	242 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	VHL	P40337	213 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ZNF137P	P52743	207 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	MMD	Q15546	238 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ASCL4	Q6XD76	172 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	DLX4	Q92988	240 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	IMPAD1	Q9NX62	359 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ZNF581	Q9P0T4	197 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SORL1	Q92673	2214 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	TMEM212	A6NML5	194 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	AMIGO2	Q86SJ2	522 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	OR52N1	Q8NH53	320 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	OR5AK2	Q8NH90	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	TSEN15	Q8WW01	171 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	RAB9B	Q9NP90	201 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ING4	Q9UNL4	249 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	LYST	Q99698	3801 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	LINC01619	G3V211	115 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SLC31A2	O15432	143 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	MT-ND4	P03905	459 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ZNF134	P52741	427 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	RBM11	P57052	281 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	NHLRC3	Q5JS37	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ATAD3C	Q5T2N8	411 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ACSM6	Q6P461	480 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	NEK7	Q8TDX7	302 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	METTL9	Q9H1A3	318 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	EDA2R	Q9HAV5	297 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	PARP11	Q9NR21	331 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	GNG12	Q9UBI6	72 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	MAGEA13P	A6NCF6	341 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	AIP	O00170	330 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	GEMIN2	O14893	280 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SPINT2	O43291	252 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	CDRT1	O95170	752 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SLURP1	P55000	103 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SRSF7	Q16629	238 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SLC25A30	Q5SVS4	291 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ADAMTSL5	Q6ZMM2	481 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ZNF497	Q6ZNH5	498 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	LINC00596	Q86U02	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	LHFPL3	Q86UP9	236 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SYS1	Q8N2H4	156 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	STX19	Q8N4C7	294 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	S100A13	Q99584	98 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	PDCD1LG2	Q9BQ51	273 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ALG8	Q9BVK2	526 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ALX4	Q9H161	411 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	AP4S1	Q9Y587	144 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRPM4-208	ENST00000597316	SNTN	A6NMZ2	147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	LANCL1	O43813	399 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	HLA-DRB1	P01911	266 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	OR8U9	P0C7N5	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	VEGFC	P49767	419 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	ACTB	P60709	375 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	MRPL28	Q13084	256 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	LSAMP	Q13449	338 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	MPV17L	Q2QL34	196 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	LIN54	Q6MZP7	749 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	MINDY2	Q8NBR6	621 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	ARPC1A	Q92747	370 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	OR4C12	Q96R67	309 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	ZNF251	Q9BRH9	671 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	ISG20L2	Q9H9L3	353 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	PAK1IP1	Q9NWT1	392 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	IL36G	Q9NZH8	169 aa		13.52	□□□□□ -0.25
TRPM4-208	ENST00000597316	NKX1-2	Q9UD57	310 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25

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