RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590874.5

CAPNS1-211, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 926 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-211ENST00000590874 AMBNQ9NP70 447 aa19.99■□□□□ 0.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V1G2O95670 118 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 IGF1P05019 195 aa19.98■□□□□ 0.79
CAPNS1-211ENST00000590874 SERPINA2P20848 420 aa19.98■□□□□ 0.79
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR8U8P0C7N1 319 aa19.93■□□□□ 0.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 ZNF491Q8N8L2 437 aa19.93■□□□□ 0.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 WSB1Q9Y6I7 421 aa19.93■□□□□ 0.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 OR4K15Q8NH41 348 aa19.92■□□□□ 0.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 ISYNA1Q9NPH2 558 aa19.92■□□□□ 0.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 BDKRB2P30411 391 aa19.91■□□□□ 0.78
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CAPNS1-211ENST00000590874 STX19Q8N4C7 294 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 OR1L1Q8NH94 360 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 Q96MT0 163 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 VSIG4Q9Y279 399 aa19.91■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 MAGEA13PA6NCF6 341 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 H3BNX3 289 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 ATP6V0E1O15342 81 aa19.9■□□□□ 0.78
CAPNS1-211ENST00000590874 SPINT2O43291 252 aa19.9■□□□□ 0.78
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