RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587928.5

ILF3-208, Transcript of interleukin enhancer binding factor 3, human

TSL 2

Gene ILF3, Length 4,230 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ILF3-208	ENST00000587928	TRAV30	A0A087WSZ9	112 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	CLDN17	P56750	224 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	MYBPH	Q13203	477 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	OXGR1	Q96P68	337 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	SCRT1	Q9BWW7	348 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	TECTA	O75443	2155 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	CAD	P27708	2225 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928		A0A1W2PNR3	127 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	VAMP5	O95183	116 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	CD3D	P04234	171 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	CLDN15	P56746	228 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	RAB31	Q13636	194 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	OTP	Q5XKR4	325 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	ADGRE4P	Q86SQ3	457 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	HOGA1	Q86XE5	327 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	NOXO1	Q8NFA2	376 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	AKIRIN1	Q9H9L7	192 aa	Predicted RBP	9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		9.46	□□□□□ -0.89
ILF3-208	ENST00000587928	CLEC18A	A5D8T8	446 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	P2RY10	O00398	339 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	AKR1C4	P17516	323 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	CLEC18C	Q8NCF0	446 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	OR2I1P	Q8NGU4	316 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	MUCL1	Q96DR8	90 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	NMES1	Q9C002	83 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	B4GALT7	Q9UBV7	327 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		9.46	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928		H3BQ15	152 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	TCN2	P20062	427 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	MC5R	P33032	325 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	APLNR	P35414	380 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	OR3A2	P47893	321 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	HGFAC	Q04756	655 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	DHRS2	Q13268	280 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	ARFRP1	Q13795	201 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	VAX1	Q5SQQ9	334 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928		Q6ZN92	141 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	GGN	Q86UU5	652 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	TMEM104	Q8NE00	496 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	C11orf40	Q8WZ69	217 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SLAMF6	Q96DU3	332 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF160	Q9HCG1	818 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SERPINA7	P05543	415 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	PMPCA	Q10713	525 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	OR10W1	Q8NGF6	305 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	LYPD6B	Q8NI32	183 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	RASL10B	Q96S79	203 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	AMBP	P02760	352 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	ABHD17B	Q5VST6	288 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	CPT1C	Q8TCG5	803 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	MITD1	Q8WV92	249 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	PRDM6	Q9NQX0	595 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	9.45	□□□□□ -0.9	8e-8	■■■■■ 28.8
ILF3-208	ENST00000587928	ZNF878	C9JN71	531 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	PGA5	P0DJD9	388 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SCGB1A1	P11684	91 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	HLA-DRB3	P79483	266 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	FRZB	Q92765	325 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SPTSSA	Q969W0	71 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	FGGY	Q96C11	551 aa		9.45	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928		G3V3Y1	287 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	RBMX	P38159	391 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	LPAR6	P43657	344 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	GLIPR1	P48060	266 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	BTNL8	Q6UX41	500 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	C6orf15	Q6UXA7	325 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	NIT1	Q86X76	327 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	ZDHHC22	Q8N966	263 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	APH1A	Q96BI3	265 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	MOB1A	Q9H8S9	216 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	MYO7B	Q6PIF6	2116 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SFTPB	P07988	381 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	IL6R	P08887	468 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	PLGLB1	Q02325	96 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928		Q0VFX4	171 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	RTBDN	Q9BSG5	229 aa	Predicted RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	ULBP2	Q9BZM5	246 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	TNFSF13	O75888	250 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	PAX1	P15863	534 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	CD1B	P29016	333 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	PAFAH1B2	P68402	229 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SPEM2	Q0P670	501 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	GFI1B	Q5VTD9	330 aa		9.44	□□□□□ -0.9
ILF3-208	ENST00000587928	SLC22A24	Q8N4F4	322 aa		9.44	□□□□□ -0.9

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