RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578896.1

GGA3-207, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 5

Gene GGA3, Length 439 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-207ENST00000578896 MYF6P23409 242 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ADARB1P78563 741 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 DGCR2P98153 550 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 PAX5Q02548 391 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 GPR50Q13585 617 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 DOC2BQ14184 412 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CT45A1Q5HYN5 189 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TEX38Q6PEX7 206 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 IZUMO1Q8IYV9 350 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 LINC00311Q8N616 119 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TMEM104Q8NE00 496 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CT45A3Q8NHU0 189 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 GHSRQ92847 366 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 RITA1Q96K30 269 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 OR5B12Q96R08 314 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
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GGA3-207ENST00000578896 ABCG5Q9H222 651 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 BABAM2Q9NXR7 383 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ETAA1Q9NY74 926 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 IL36GQ9NZH8 169 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa7□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TNCP24821 2201 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 UBE2QL1A1L167 161 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 AP4M1O00189 453 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MOSP00540 346 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 HBZP02008 142 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MAS1P04201 325 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 GTF2F2P13984 249 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CNTFRP26992 372 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CD1BP29016 333 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ECI1P42126 302 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 RIPK1Q13546 671 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 GNMTQ14749 295 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 RAB12Q6IQ22 244 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 SMIM19Q96E16 107 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 OR14A2Q96R54 314 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.99□□□□□ -1.29
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GGA3-207ENST00000578896 GNG12Q9UBI6 72 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.99□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.99□□□□□ -1.29
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GGA3-207ENST00000578896 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 G3V318 75 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ORC5O43913 435 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 IL3RAP26951 378 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 DCKP27707 260 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 KIR2DS1Q14954 304 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MPV17LQ2QL34 196 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CCDC58Q4VC31 144 aa6.98□□□□□ -1.29
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GGA3-207ENST00000578896 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 STX19Q8N4C7 294 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 COMMD1Q8N668 190 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ZNF555Q8NEP9 628 aa6.98□□□□□ -1.29
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GGA3-207ENST00000578896 GGHQ92820 318 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 PGLYRP3Q96LB9 341 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 KCTD7Q96MP8 289 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 KLK15Q9H2R5 256 aa6.98□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.98□□□□□ -1.29
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GGA3-207ENST00000578896 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 SPINT2O43291 252 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 ELANEP08246 267 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 MYL12AP19105 171 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 VDAC1P21796 283 aa6.97□□□□□ -1.29
GGA3-207ENST00000578896 SOX6P35712 828 aa6.97□□□□□ -1.29
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