RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578093.1

PTPRM-206, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 464 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-206ENST00000578093 DEGS2Q6QHC5 323 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PIGWQ7Z7B1 504 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FOXRED2Q8IWF2 684 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SLC35F2Q8IXU6 374 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF679Q8IYX0 411 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FAM58AQ8N1B3 248 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 DRAXINQ8NBI3 349 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR11H1Q8NG94 326 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR5D18Q8NGL1 313 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR13A1Q8NGR1 328 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR2T29Q8NH02 315 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR9G1Q8NH87 305 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 UBALD1Q8TB05 177 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MYOZ3Q8TDC0 251 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 DCUN1D4Q92564 292 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CORO2AQ92828 525 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 RPEQ96AT9 228 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ISOC1Q96CN7 298 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 RNFT2Q96EX2 444 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 BORCS8Q96FH0 119 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CYYR1Q96J86 154 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 RITA1Q96K30 269 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SPACA5Q96QH8 159 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 OR5B12Q96R08 314 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 FEVQ99581 238 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TBX5Q99593 518 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MROQ9BYG7 248 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 YIPF3Q9GZM5 350 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CHST5Q9GZS9 411 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 COMMD4Q9H0A8 199 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ABCG5Q9H222 651 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 REEP1Q9H902 201 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PLEKHA1Q9HB21 404 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ADGRL4Q9HBW9 690 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SLC25A19Q9HC21 320 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SEPSECSQ9HD40 501 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 RETNQ9HD89 108 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PLSCR3Q9NRY6 295 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ARGLU1Q9NWB6 273 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF446Q9NWS9 450 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TAS2R3Q9NYW6 316 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CALYQ9NYX4 217 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PSG11Q9UQ72 335 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa3.04□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.04□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 HSD17B6O14756 317 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SLC31A2O15432 143 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 CCDC22O60826 627 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 ZNF254O75437 659 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 IGHG4P01861 327 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 ZNF44P15621 663 aa3.03□□□□□ -1.92
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PTPRM-206ENST00000578093 ZNF616Q08AN1 781 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 EBI3Q14213 229 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 CDK5R1Q15078 307 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 KRBOX4Q5JUW0 171 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 SLX4IPQ5VYV7 408 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TEX38Q6PEX7 206 aa3.03□□□□□ -1.92
PTPRM-206ENST00000578093 TMEM88Q6PEY1 159 aa3.03□□□□□ -1.92
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