RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 NCKAP5O14513 1909 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MYH8P13535 1937 aa2.56□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 A0A0G2JMM0 328 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PPB8 328 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 A0A1W2PRS3 328 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C7orf66A4D0T2 115 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM202A6NGA9 273 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 IFITM10A6NMD0 228 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 DISP2A7MBM2 1401 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HMSDA8MTL9 139 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 KIR3DP1A8MWS1 328 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C9JAW5 83 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 F5H697 171 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 G3V2L1 256 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 H7C1C5 153 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SH2D1BO14796 132 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CLDN11O75508 207 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 DHRS3O75911 302 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 YIF1AO95070 293 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 AIFM1O95831 613 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OXTP01178 125 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HLA-DQA2P01906 255 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TTRP02766 147 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 IL3P08700 152 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 FAM157CP0CG43 387 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SRD5A1P18405 259 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RAB5AP20339 215 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NTF3P20783 257 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GPX3P22352 226 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 EDNRAP25101 427 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RPL3P39023 403 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SSR4P51571 173 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR12D2P58182 307 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RPS13P62277 151 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LCN6P62502 163 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 UBA52P62987 128 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CRB1P82279 1406 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 UNC119Q13432 240 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CUL7Q14999 1698 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR1C1Q15619 314 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TRIP11Q15643 1979 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CCL15Q16663 113 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C2orf68Q2NKX9 166 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 KHDC3LQ587J8 217 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 BCL2L15Q5TBC7 163 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ALKAL1Q6UXT8 129 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM64Q6YI46 380 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 IL34Q6ZMJ4 242 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 P2RY8Q86VZ1 359 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PPP1R27Q86WC6 154 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RALGAPBQ86X10 1494 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C20orf196Q8IYI0 205 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF440Q8IYI8 595 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SLC35G3Q8N808 338 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM178AQ8NBL3 297 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SCCPDHQ8NBX0 429 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR4C3Q8NH37 302 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD8Q8NHS3 518 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 C15orf40Q8WUR7 153 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 BLNKQ8WV28 456 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 SECTM1Q8WVN6 248 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RXFP2Q8WXD0 754 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM106AQ96A25 262 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PHYHIPLQ96FC7 376 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 WDYHV1Q96HA8 205 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 MS4A4EQ96PG1 132 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 LYSMD1Q96S90 227 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TBX15Q96SF7 602 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PSMB7Q99436 277 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 GFI1Q99684 422 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM70Q9BUB7 260 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 OR2H1Q9GZK4 316 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 COA1Q9GZY4 146 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 RNASE7Q9H1E1 156 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 FBXL15Q9H469 300 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF665Q9H7R5 613 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 PELI2Q9HAT8 420 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 KIF13BQ9NQT8 1826 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF586Q9NXT0 402 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 UGGT1Q9NYU2 1555 aa2.55□□□□□ -2
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL13Q9P2N7 655 aa2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms