RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000576691.5

TBCD-223, Transcript of tubulin folding cofactor D, human

TSL 3

Gene TBCD, Length 929 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBCD-223	ENST00000576691	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		13.82	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF230	Q9UIE0	474 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	F2RL2	O00254	374 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CCL3L1	P16619	93 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	ARF6	P62330	175 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	HLA-DRB3	P79483	266 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	HTD2	P86397	168 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF846	Q147U1	533 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691		Q6ZPA2	131 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691		Q8N402	240 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	BEST4	Q8NFU0	473 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	SRR	Q9GZT4	340 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	ANXA10	Q9UJ72	324 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CR1	P17927	2039 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		13.81	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	VPS13C	Q709C8	3753 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	FABP7	O15540	132 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CD5L	O43866	347 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	HBZ	P02008	142 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	INHBB	P09529	407 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	GSTT2B	P0CG30	244 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	PRTN3	P24158	256 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	FPR2	P25090	351 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CD40LG	P29965	261 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	PPP5C	P53041	499 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	DGCR2	P98153	550 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	STEAP3	Q658P3	488 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	GCDH	Q92947	438 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	KLK11	Q9UBX7	282 aa		13.8	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	TOX4	O94842	621 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	GSTT2	P0CG29	244 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	TBP	P20226	339 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	SSTR5	P35346	364 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	TAS2R46	P59540	309 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691		Q3ZCU0	254 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	LY6G6F	Q5SQ64	297 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691		Q8N7P7	452 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	DEDD2	Q8WXF8	326 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	SIRPD	Q9H106	197 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	AUP1	Q9Y679	476 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2	1e-6	■■■□□ 17.1
TBCD-223	ENST00000576691	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691		A0A087X0M5	115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691		A0A1B0GX30	115 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	MEIS3P1	A6NDR6	274 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CSF1	P09603	554 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	SCT	P09683	121 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	MMP9	P14780	707 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	ACTBL2	Q562R1	376 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM229B	Q8NBD8	167 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	OR1L1	Q8NH94	360 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	RFESD	Q8TAC1	157 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	SNAPC3	Q92966	411 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CABLES2	Q9BTV7	478 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	CCDC32	Q9BV29	185 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	JPT1	Q9UK76	154 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBCD-223	ENST00000576691	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	ZNF736	B4DX44	427 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	RGS11	O94810	467 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	ZBTB25	P24278	435 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	CD34	P28906	385 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	GDNF	P39905	211 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	OR3A3	P47888	321 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	LOXL3	P58215	753 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	TAS2R19	P59542	299 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	AP3S2	P59780	193 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	ARPC4	P59998	168 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	IL1F10	Q8WWZ1	152 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	UPRT	Q96BW1	309 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	TSC22D3	Q99576	134 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	TOLLIP	Q9H0E2	274 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	TMEM133	Q9H2Q1	129 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBCD-223	ENST00000576691	OR2S2	Q9NQN1	319 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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