RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567377.5

COMMD4-218, Transcript of COMM domain containing 4, humanhuman

TSL 3

Gene COMMD4, Length 461 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD4-218ENST00000567377 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CEACAM19Q7Z692 300 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 C11orf44Q8N8P7 122 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM104Q8NE00 496 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC107Q8WV48 283 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 LEAP2Q969E1 77 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR4F4Q96R69 305 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.5□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1W2PPI3 338 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 WIPF1O43516 503 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 ARL6IP5O75915 188 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 BPNT1O95861 308 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 LOXL3P58215 753 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 UTF1Q5T230 341 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 DRAM1Q8N682 238 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 KCNIP1Q9NZI2 227 aa14.49□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 HSD17B6O14756 317 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 FGF16O43320 207 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TXNL1O43396 289 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 IGHV3-7P01780 117 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CD28P10747 220 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CRHBPP24387 322 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 HTR2CP28335 458 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 HES1Q14469 280 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 LIPKQ5VXJ0 399 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 Q6ZS46 218 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR56B4Q8NH76 319 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 GNG12Q9UBI6 72 aa14.48□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 C12orf77C9JDV5 145 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SLC22A1O15245 554 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 MPIG6BO95866 241 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 AMY1AP04745 511 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 AMY2AP04746 511 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 HSMCR30P0CW71 290 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CPEP16870 476 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM11P17152 192 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 PSMD7P51665 324 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CD83Q01151 205 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 EBI3Q14213 229 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 INSL4Q14641 139 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SIGIRRQ6IA17 410 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 IZUMO2Q6UXV1 221 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR4K15Q8NH41 348 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CCDC90BQ9GZT6 254 aa14.47□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 HBZP02008 142 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 VSIG8P0DPA2 414 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 ZNF137PP52743 207 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 FAM27D1Q5T7N8 215 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 MOB3BQ86TA1 216 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 SGCDQ92629 289 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 FAM46BQ96A09 425 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TM2D1Q9BX74 207 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 RAB26Q9ULW5 256 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 TGP01266 2768 aa14.46□□□□□ -0.09
COMMD4-218ENST00000567377 UBE2QL1A1L167 161 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 ERICH4A6NGS2 130 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 KCNAB3O43448 404 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 RGS11O94810 467 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 CD1BP29016 333 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 HTD2P86397 168 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 LY6G6FQ5SQ64 297 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 IZUMO1Q8IYV9 350 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 OR2T10Q8NGZ9 312 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM203Q969S6 136 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 R3HDM4Q96D70 268 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 MGLLQ99685 303 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.45□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 A0A1W2PPE3 182 aa14.44□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.44□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP14.44□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 IGKV1D-33P01593 117 aa14.44□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 IGKV1-33P01594 117 aa14.44□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.44□□□□□ -0.1
COMMD4-218ENST00000567377 CHATP28329 748 aa14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms