RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560983.1

HERC1-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase family member 1, humanhuman

TSL 2

Gene HERC1, Length 457 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC1-211ENST00000560983 KIR2DL5AQ8N109 375 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CCDC63Q8NA47 563 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SPC24Q8NBT2 197 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 OR8H1Q8NGG4 311 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 OR5A2Q8NGI9 324 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 ZNRF4Q8WWF5 429 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 LEAP2Q969E1 77 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TAMM41Q96BW9 452 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 MS4A10Q96PG2 267 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 SPACA5Q96QH8 159 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 CHST6Q9GZX3 395 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 HRH4Q9H3N8 390 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 ABCB9Q9NP78 766 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 AIG1Q9NVV5 245 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 TAS2R3Q9NYW6 316 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 PSG11Q9UQ72 335 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 GMEB1Q9Y692 573 aa2.66□□□□□ -1.98
HERC1-211ENST00000560983 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 A0A1W2PN81 502 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 EFCAB9A8MZ26 197 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 RENP00797 406 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TRBV12-3P01733 135 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CSTBP04080 98 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 GPX2P18283 190 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CFL1P23528 166 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 HLA-DMBP28068 263 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CD1BP29016 333 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 SLC6A6P31641 620 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CHRNA7P36544 502 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 HAAOP46952 286 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 OR3A1P47881 315 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CX3CR1P49238 355 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 FXYD6P3P58550 94 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TAS2R41P59536 307 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 NDPQ00604 133 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TAF13Q15543 124 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 SNCBQ16143 134 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TMEM30BQ3MIR4 351 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 SLC36A3Q495N2 470 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 ZBED5Q49AG3 693 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 SLC16A13Q7RTY0 426 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 DCXRQ7Z4W1 244 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 ADCK1Q86TW2 530 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 NFE4Q86UQ8 179 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 ANGPTL5Q86XS5 388 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 NRMQ8IXM6 262 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CNPY4Q8N129 248 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 C6orf223Q8N319 242 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 FTMTQ8N4E7 242 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 YIPF7Q8N8F6 280 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 SPATA4Q8NEY3 305 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 OR11H2Q8NH07 326 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 GPX7Q96SL4 187 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 MBOAT4Q96T53 435 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 NMNAT3Q96T66 252 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 RARRES2Q99969 163 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 COPS4Q9BT78 406 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 BARHL1Q9BZE3 327 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 C20orf27Q9GZN8 174 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 RGCCQ9H4X1 137 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 VIPAS39Q9H9C1 493 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 PARP11Q9NR21 331 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CENPMQ9NSP4 180 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 MTCH1Q9NZJ7 389 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 COPS3Q9UNS2 423 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 FOXA2Q9Y261 457 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 SELENOKQ9Y6D0 94 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 U3KQV3 271 aa2.65□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 A0A1W2PPE3 182 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TMEM120BA0PK00 339 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 OR5B21A6NL26 309 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 J3QT63 122 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 HSD17B6O14756 317 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 AIREO43918 545 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 OR2A4O95047 310 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 NDUFB4O95168 129 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 HLA-DRB1P01911 266 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 FOLR2P14207 255 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 MPZP25189 248 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 NFYBP25208 207 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 PAFAH1B1P43034 410 aa2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP2.64□□□□□ -1.99
HERC1-211ENST00000560983 TPPP2P59282 170 aa2.64□□□□□ -1.99
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