RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557477.1

PRPF39-212, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

TSL 5

Gene PRPF39, Length 724 nt, Biotype nonsense mediated decay.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-212ENST00000557477 TDGF1P3P51864 188 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DLX1P56177 255 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 WNT4P56705 351 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CDC42P60953 191 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CCL7P80098 99 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 EMX2Q04743 252 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SKP2Q13309 424 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR4D1Q15615 310 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DEFB109BQ30KR1 87 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 LINC00303Q3SY05 128 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 FAM74A1Q5RGS3 127 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CASC10Q5T4H9 136 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TRIQKQ629K1 86 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RNF165Q6ZSG1 346 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MRPL21Q7Z2W9 205 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 GRINAQ7Z429 371 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 LYG2Q86SG7 212 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PIANPQ8IYJ0 282 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PGAM4Q8N0Y7 254 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 C17orf78Q8N4C9 275 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TPRX1Q8N7U7 411 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 FBXL13Q8NEE6 735 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR4D6Q8NGJ1 314 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR4A15Q8NGL6 344 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR13D1Q8NGV5 346 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR5K1Q8NHB7 308 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DYNC2LI1Q8TCX1 351 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ACOT12Q8WYK0 555 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 UCN3Q969E3 161 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CREB3L1Q96BA8 519 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM56Q96MV1 263 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SRRQ9GZT4 340 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CISHQ9NSE2 258 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DDIT4Q9NX09 232 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 KCNIP1Q9NZI2 227 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CALML5Q9NZT1 146 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 FBXL3Q9UKT7 428 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa3.15□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ASXL3Q9C0F0 2248 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TRAV25A0A0B4J276 109 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 A0A0U1RQS6 177 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SPTY2D1-AS1A0A0U1RR47 76 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 A0A1B0GUH1 482 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TMEM72A0PK05 275 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 PANO1I0J062 215 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DFFAO00273 331 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CDIPTO14735 213 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 UBDO15205 165 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TGOLN2O43493 480 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 AQP8O94778 261 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 C1orf105O95561 183 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RPN2P04844 631 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CRYBA1P05813 215 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TSPAN19P0C672 248 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CHTF8P0CG12 524 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 GTF2F2P13984 249 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 TCN2P20062 427 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 GSTM3P21266 225 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 GNRHRP30968 328 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SDC4P31431 198 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 BTCP35070 178 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 IFNGR2P38484 337 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CTRLP40313 264 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 GLP1RP43220 463 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 UQCRFS1P47985 274 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 EVX1P49640 407 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DAOAP59103 153 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MAXP61244 160 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DEFA5Q01523 94 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ACVR1Q04771 509 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 ZNF616Q08AN1 781 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SLAMF1Q13291 335 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 FZD2Q14332 565 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 NEDD8Q15843 81 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 IMPG1Q17R60 797 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SMIM21Q3B7S5 101 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 C9orf135Q5VTT2 229 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 KDM4DQ6B0I6 523 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 REEP3Q6NUK4 255 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 C22orf39Q6P5X5 142 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 BAP18Q8IXM2 172 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 SVBPQ8N300 66 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 DCAF4L2Q8NA75 395 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR9K2Q8NGE7 335 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR10W1Q8NGF6 305 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR8D4Q8NGM9 314 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR6K2Q8NGY2 324 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 OR8U1Q8NH10 309 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 MCFD2Q8NI22 146 aa3.14□□□□□ -1.91
PRPF39-212ENST00000557477 CD200R1Q8TD46 325 aa3.14□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms