RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555806.5

NEDD1-208, Transcript of neural precursor cell expressed, developmentally down-regulated 1, humanhuman

TSL 4

Gene NEDD1, Length 565 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1-208ENST00000555806 RAB9BQ9NP90 201 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 GHRLQ9UBU3 117 aa14.69□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 UBE2QL1A1L167 161 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 C12orf77C9JDV5 145 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 HSD17B6O14756 317 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 SPINT2O43291 252 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 RGS10O43665 173 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 MPIG6BO95866 241 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM11P17152 192 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 FUT3P21217 361 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 PRR18Q8N4B5 295 aa14.68□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 OR5AU1Q8NGC0 362 aa14.68□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 GNG12Q9UBI6 72 aa14.68□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 AMY2AP04746 511 aa14.67□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 OPN1MW2P0DN77 364 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 OPN1MW3P0DN78 364 aa14.67□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 REG1BP48304 166 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 GP2P55259 537 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM203Q969S6 136 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 R3HDM4Q96D70 268 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 DUSP21Q9H596 190 aa14.67□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 CA11O75493 328 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 IGKV1D-33P01593 117 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 IGKV1-33P01594 117 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 HBZP02008 142 aa14.66□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 OR10K2Q6IF99 312 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 LINC00311Q8N616 119 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 OR4F17Q8NGA8 305 aa14.66□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 OR1L1Q8NH94 360 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 OR4F4Q96R69 305 aa14.66□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 NOTCH1P46531 2555 aa14.65□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 A0A1W2PRX2 142 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 SC5DO75845 299 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 UCHL1P09936 223 aa14.65□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 RPS25P62851 125 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 C1orf100Q5SVJ3 147 aa14.65□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 CYYR1Q96J86 154 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 CNBD2Q96M20 576 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.65□□□□□ -0.06
NEDD1-208ENST00000555806 KCNK15Q9H427 330 aa14.65□□□□□ -0.06
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NEDD1-208ENST00000555806 SLC31A2O15432 143 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 VSIG8P0DPA2 414 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 CRHBPP24387 322 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 MLLT11Q13015 90 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 TPBGQ13641 420 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 TRAM1Q15629 374 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 Q3ZCU0 254 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 PRSS48Q7RTY5 328 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 OR4X2Q8NGF9 303 aa14.64□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.64□□□□□ -0.07
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NEDD1-208ENST00000555806 KHDC1LQ5JSQ8 128 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 C5orf56Q8N8D9 126 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.63□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 G3V4G9 280 aa14.62□□□□□ -0.07
NEDD1-208ENST00000555806 SLC22A1O15245 554 aa14.62□□□□□ -0.07
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