RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 TAS2R46P59540 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SEC61GP60059 68 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 HLA-DRB5Q30154 266 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 Q8IYB0 196 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR8B3Q8NGG8 313 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR2K2Q8NGT1 345 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 SORT1Q99523 831 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 QTRT1Q9BXR0 403 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV25A0A0B4J276 109 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 FOXH1O75593 365 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 OR10V1Q8NGI7 309 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TSSK2Q96PF2 358 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 HIST1H2BLQ99880 126 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 LOC105371242A0A075B767 164 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 PPIAL4GP0DN37 164 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FUT3P21217 361 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 IL13RA2Q14627 380 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 SYT14P1Q58G82 188 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 RASL11AQ6T310 242 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 LYG2Q86SG7 212 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 C20orf196Q8IYI0 205 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 PIGCQ92535 297 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM160Q9NX00 188 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQD3 144 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 VPREB1P12018 145 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 SEC11AP67812 179 aa5.54□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CDCP2Q5VXM1 449 aa5.54□□□□□ -1.52
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PTPRB-210ENST00000551525 SFXN3Q9BWM7 321 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 GABARAPL3Q9BY60 117 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 FRRS1LQ9P0K9 344 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 CLCF1Q9UBD9 225 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 ANXA10Q9UJ72 324 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 A0A087WWC5 75 aa5.53□□□□□ -1.52
PTPRB-210ENST00000551525 OR2W5A6NFC9 320 aa5.53□□□□□ -1.52
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