RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520887.1

FAM49B-218, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 2

Gene FAM49B, Length 640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-218	ENST00000520887	CMSS1	Q9BQ75	279 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TM2D1	Q9BX74	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DCSTAMP	Q9H295	470 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	NDUFA13	Q9P0J0	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	GNG12	Q9UBI6	72 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	SESN1	Q9Y6P5	492 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	FLNB	O75369	2602 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	NOTCH2	Q04721	2471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887		A0A075B6Q4	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887		A0A0G2JK05	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	SMIM30	A4D0T7	59 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	PRSS29P	A6NIE9	313 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TMEM14DP	A8MWL7	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TRIM77	I1YAP6	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	RGS5	O15539	181 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ORC5	O43913	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ZNF737	O75373	536 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ARG1	P05089	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	SMIM18	P0DKX4	95 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	SELL	P14151	372 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ADRA2C	P18825	462 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	PRTN3	P24158	256 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	NFYB	P25208	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ZFP36	P26651	326 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	S100A5	P33763	92 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	OR3A1	P47881	315 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	PTTG1IP	P53801	180 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	CLDN12	P56749	244 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	OR10A3	P58181	314 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	VBP1	P61758	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	PAX8	Q06710	450 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	AES	Q08117	197 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	CCDC144NL	Q6NUI1	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ZNF841	Q6ZN19	808 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887		Q8NFD4	153 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	OR4S1	Q8NGB4	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TNFRSF14	Q92956	283 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ARL11	Q969Q4	196 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	GALM	Q96C23	342 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	YIPF6	Q96EC8	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	NEU1	Q99519	415 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	RAB18	Q9NP72	206 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	IFT46	Q9NQC8	304 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	C19orf12	Q9NSK7	152 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	RHBDL2	Q9NX52	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	HSF4	Q9ULV5	492 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	RBM7	Q9Y580	266 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	MED13L	Q71F56	2210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	CCDC168	Q8NDH2	2452 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887		A0A1B0GW55	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	MEIOC	A2RUB1	952 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DIRC3	C9JPN6	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887		F8VVB4	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887		F8VWA3	439 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TNFRSF13B	O14836	293 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	NPFF	O15130	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	TXNL1	O43396	289 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	NUDT3	O95989	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	IGHV1-69	P01742	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DUX4L2	P0CJ85	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DUX4L3	P0CJ86	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DUX4L4	P0CJ87	422 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DUX4L5	P0CJ88	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DUX4L6	P0CJ89	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	DUX4L7	P0CJ90	424 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	HIST1H1D	P16402	221 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	ZNF182	P17025	639 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	GCSH	P23434	173 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	COX7A1	P24310	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	CDK2	P24941	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	CHAT	P28329	748 aa		4.86	□□□□□ -1.63
FAM49B-218	ENST00000520887	S100G	P29377	79 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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