RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517309.5

PTDSS1-202, Transcript of phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTDSS1, Length 5,177 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC35B3Q9H1N7 401 aa15.14■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SNX22Q96L94 193 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 DYNLT3P51808 116 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM18Q96B42 140 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC25A22Q9H936 323 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 FCGR3AP08637 254 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MC5RP33032 325 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 PDPNQ86YL7 162 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ITLN1Q8WWA0 313 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MRGPRFQ96AM1 343 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM208Q9BTX3 173 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SULT1A1P50225 295 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 STXBP6Q8NFX7 210 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ABHD14AQ9BUJ0 271 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MPV17P39210 176 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 PCGF1Q9BSM1 259 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 DOK5Q9P104 306 aa15.13■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SLC31A2O15432 143 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 IGHMP01871 453 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 EFNB2P52799 333 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 VAX1Q5SQQ9 334 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 NHLRC2Q8NBF2 726 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 CCL13Q99616 98 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MANBALQ9NQG1 85 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ELOVL5Q9NYP7 299 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 CLDN34H7C241 214 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TOX4O94842 621 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 HPRT1P00492 218 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 RAB5AP20339 215 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 APCDD1LQ8NCL9 501 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 OR1B1Q8NGR6 318 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 BLNKQ8WV28 456 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF488Q96MN9 340 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SIPA1L1O43166 1804 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TET1Q8NFU7 2136 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 NPY1RP25929 384 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 LINC00470Q9BZP3 86 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 C1orf100Q5SVJ3 147 aa15.12■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 FDCSPQ8NFU4 85 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 GATCO43716 136 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 C10orf128Q5T292 105 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SAXO1Q8IYX7 474 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 HSBP1O75506 76 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 OR1L6Q8NGR2 347 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 OR1L1Q8NH94 360 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TIMP4Q99727 224 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 CSRP1P21291 193 aaKnown RBP15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF658BQ4V348 819 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ZNF66Q6ZN08 573 aa15.11■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 KCNMB1Q16558 191 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 FA2HQ7L5A8 372 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SRXN1Q9BYN0 137 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 J3QR06 171 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 GYPAP02724 150 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 AMELYQ99218 206 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TNFRSF19Q9NS68 423 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 OPN4Q9UHM6 478 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 CLEC12BQ2HXU8 276 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM45BQ96B21 275 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 G6PCP35575 357 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SSX7Q7RTT5 188 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 LPAR5Q9H1C0 372 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa15.1■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 NKX2-6A6NCS4 301 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 RFLNBQ8N5W9 214 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 LPAR2Q9HBW0 351 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ICE1Q9Y2F5 2266 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 Q6ZT83 130 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 LYZL2Q7Z4W2 148 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM229AB2RXF0 380 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 OR2H2O95918 312 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 HBZP02008 142 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 ZP3P21754 424 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 PERPQ96FX8 193 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 GVINP1Q7Z2Y8 2422 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 PLA2G10O15496 165 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 PSG2P11465 335 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 OR8I2Q8N0Y5 310 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 DYRK2Q92630 601 aa15.09■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 SYNGR3O43761 229 aa15.08■□□□□ 0.01
PTDSS1-202ENST00000517309 TMEM105Q8N8V8 129 aa15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms