RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516272.1

RNU6-277P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 277, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-277P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SBNO1A3KN83 1393 aa-0.58□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 PTMAP06454 111 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 FGF4P08620 206 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF3P17036 446 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPATA31B1PQ5VZV4 182 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TMEM53Q6P2H8 277 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAS2R42Q7RTR8 314 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q8N6K4 173 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CYGBQ8WWM9 190 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAAP24Q9BTP7 215 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 CDCA4Q9BXL8 241 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-0.59□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 NCOR2Q9Y618 2525 aa-0.6□□□□□ -2.5
RNU6-277P-201ENST00000516272 A0A1B0GXF2 115 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SIVA1O15304 175 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 LTAP01374 205 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MBD3L1Q8WWY6 194 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 IL22Q9GZX6 179 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRLF2Q9HC73 371 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 EXPH5Q8NEV8 1989 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 INSRP06213 1382 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC35A2P78381 396 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 IFFO1Q0D2I5 559 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CEACAM16Q2WEN9 425 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SPANXN2Q5MJ10 180 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 OLIG3Q7RTU3 272 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GATD1Q8NB37 220 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBX5Q99593 518 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 APOL4Q9BPW4 351 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM192AQ9GZU8 254 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 NT5C3AQ9H0P0 336 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 NIT2Q9NQR4 276 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLAC8Q9NZF1 115 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GLS2Q9UI32 602 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 HHLA3Q9XRX5 114 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ALG5Q9Y673 324 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 LRRIQ4A6NIV6 560 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRAPPC6AO75865 159 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CIAO1O76071 339 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ZNF728P0DKX0 622 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ESDP10768 282 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CD82P27701 267 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CBX5P45973 191 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 REG1BP48304 166 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 Q1T7F1 81 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 C7orf65Q6ZTY9 151 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TEX9Q8N6V9 391 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SUN5Q8TC36 379 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TSKUQ8WUA8 353 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 PLIN2Q99541 437 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MIEN1Q9BRT3 115 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 DOHHQ9BU89 302 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 REG4Q9BYZ8 158 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SCML1Q9UN30 329 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MDFIC2A0A1B0GVS7 189 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 J3QLI3 93 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 DNAJB6O75190 326 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GABRR2P28476 465 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 HSPA13P48723 471 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TAS2R60P59551 318 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 RAB2AP61019 212 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 RHOAP61586 193 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 RPL31P62899 125 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC35B1P78383 322 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MOGQ16653 247 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 LGALS9BQ3B8N2 356 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MAJINQ3KP22 176 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR10K2Q6IF99 312 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 OR51A7Q8NH64 312 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 EBNA1BP2Q99848 306 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 VCX3BQ9H321 246 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GOLPH3Q9H4A6 298 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 DIABLOQ9NR28 239 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FIS1Q9Y3D6 152 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM215AQ9Y5M1 114 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GRIN2BQ13224 1484 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 MED12Q93074 2177 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 KLK1P06870 262 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SLC2A1P11166 492 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CRHBPP24387 322 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 PYCR1P32322 319 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 HES3Q5TGS1 186 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 CLEC20AQ6ZU45 233 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 GAPTQ8N292 157 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 LYRM4Q9HD34 91 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 SNX12Q9UMY4 172 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-277P-201ENST00000516272 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa-0.65□□□□□ -2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.3 ms