RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TAS2R20P59543 309 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GNG2P59768 71 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 QRFPP83859 136 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SCN1BQ07699 218 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MAB21L1Q13394 359 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ARFRP1Q13795 201 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF181Q2M3W8 571 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 HFEQ30201 348 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CDNFQ49AH0 187 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF626Q68DY1 528 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OR10K2Q6IF99 312 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SNX29P2Q8IUI4 249 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 Q8N402 240 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 FAM89BQ8N5H3 189 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 Q8NFD4 153 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NEUROG1Q92886 237 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM18Q96B42 140 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SLC25A38Q96DW6 304 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GAL3ST1Q99999 423 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TAS2R8Q9NYW2 309 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa6.08□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 A0A0G2JMP0 313 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 A0A0X1KG70 313 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SERPINE3A8MV23 424 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GABARAPH6UMI1 98 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PDCD6O75340 191 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CA11O75493 328 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RBBP9O75884 186 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TSPAN9O75954 239 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SFTPBP07988 381 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CD3GP09693 182 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PMELP40967 661 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NPBWR2P48146 333 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 EFNB2P52799 333 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ACTBP60709 375 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ACTG1P63261 375 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 CCL8P80075 99 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MRPS11P82912 194 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 UNC119Q13432 240 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TAF9Q16594 264 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MICBQ29980 383 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 WDR82Q6UXN9 313 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM104Q8NE00 496 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 OR4M2Q8NGB6 313 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NEK7Q8TDX7 302 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 LRRC29Q8WV35 223 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZFAND2BQ8WV99 257 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TIMD4Q96H15 378 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 FOXC2Q99958 501 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SOSTQ9BQB4 213 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NRIP2Q9BQI9 281 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 IFT46Q9NQC8 304 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 FUOMA2VDF0 154 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ISPDA4D126 451 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NKX6-3A6NJ46 265 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SRRM5B3KS81 715 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NDUFA2O43678 99 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 RHBDL1O75783 438 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 UPK1BO75841 260 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 NDUFB8O95169 186 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 IGKV1D-12P01611 117 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF44P15621 663 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 KCNJ3P48549 501 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 SNU13P55769 128 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 GMFBP60983 142 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ZNF146Q15072 292 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 MPPED2Q15777 294 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 PIGYQ3MUY2 71 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 ESCO2Q56NI9 601 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC3-210ENST00000512194 TMEM255AQ5JRV8 349 aa6.06□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms