RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511663.5

SH3BP2-220, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 966 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF581Q9P0T4 197 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GNG12Q9UBI6 72 aa15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 LINC01548A6NM66 108 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 BAG2O95816 211 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GPR50Q13585 617 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM30BQ3MIR4 351 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 C6orf183Q5T699 404 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 C11orf87Q6NUJ2 197 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 OR8U1Q8NH10 309 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GHSRQ92847 366 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 DCLRE1BQ9H816 532 aa15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ELANEP08246 267 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 VDAC1P21796 283 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 Q499Y3 187 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 YIF1BQ5BJH7 314 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TRAT1Q6PIZ9 186 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PRR18Q8N4B5 295 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 JAGN1Q8N5M9 183 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 Q8N9W7 124 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 OR5M8Q8NGP6 311 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TFAP2CQ92754 450 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 RDH12Q96NR8 316 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 DUX3Q96PT4 197 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 S1PR3Q99500 378 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ETAA1Q9NY74 926 aa15.16■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 WBP4O75554 376 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SOX6P35712 828 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 FOXE3Q13461 319 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 KIR2DS1Q14954 304 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 LCNL1Q6ZST4 164 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 Q8N6K4 173 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 ORAI1Q96D31 301 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM80Q96HE8 168 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 RAX2Q96IS3 184 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 PEX16Q9Y5Y5 336 aa15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP15.15■□□□□ 0.02
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PP11 408 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 H0YHG0 523 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 GPX5O75715 221 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 OR5H8P0DN80 308 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 C9orf66Q5T8R8 295 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 RAB12Q6IQ22 244 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 OR13C5Q8NGS8 318 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 OR4K15Q8NH41 348 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MUL1Q969V5 352 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 KCNIP1Q9NZI2 227 aa15.14■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 C12orf77C9JDV5 145 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CA11O75493 328 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 STEAP3Q658P3 488 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 AWAT2Q6E213 333 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM104Q8NE00 496 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SETD9Q8NE22 299 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 OR10V1Q8NGI7 309 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 PLSCR3Q9NRY6 295 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CLEC2DQ9UHP7 191 aa15.13■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 A0A1W2PPK0 400 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 HBZP02008 142 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 MAS1P04201 325 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TAS2R43P59537 309 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TTC23Q5W5X9 447 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 DMKNQ6E0U4 476 aaPredicted RBP15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 TMEM65Q6PI78 240 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CDH26Q8IXH8 852 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CYGBQ8WWM9 190 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SELENOIQ9C0D9 397 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 OR2S2Q9NQN1 319 aa15.12■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM90A10PA6NDY2 464 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM90A7PA6NKC0 464 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ZNF736B4DX44 427 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 SLC31A2O15432 143 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 GLAP06280 429 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 FSTP19883 344 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 FUT3P21217 361 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CAPGP40121 348 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 F2RL1P55085 397 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 DEFB136Q30KP8 78 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CT45A1Q5HYN5 189 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 ZFP41Q8N8Y5 198 aa15.11■□□□□ 0.01
SH3BP2-220ENST00000511663 CT45A3Q8NHU0 189 aa15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms