RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508148.1

MIB2-223, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, human

TSL 4

Gene MIB2, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIB2-223	ENST00000508148	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF596	Q8TC21	504 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	KCTD7	Q96MP8	289 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR51E2	Q9H255	320 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LINC00574	Q9H8X3	128 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF702P	Q9H963	129 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	RAB9B	Q9NP90	201 aa		13.37	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	GZMH	P20718	246 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	GADD45A	P24522	165 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	GDNF	P39905	211 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	AANAT	Q16613	207 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZPA2	131 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	GAPT	Q8N292	157 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NICN1	Q9BSH3	213 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	MINOS1-NBL1	R4GNA1	71 aa		13.36	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	FAM172BP	A6NC97	362 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ORC5	O43913	435 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	MT-ND4	P03905	459 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NFYB	P25208	207 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	FAM189A2	Q15884	450 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	PLA1A	Q53H76	456 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CCDC107	Q8WV48	283 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	MALSU1	Q96EH3	234 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LIN7B	Q9HAP6	207 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		13.35	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148		A0A0A6YYD4	124 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TRAV39	A0A0B4J263	110 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	UBE2QL1	A1L167	161 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NOTO	A8MTQ0	251 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TOR1A	O14656	332 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	JUNB	P17275	347 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	HTR1D	P28221	377 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	RAB13	P51153	203 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	TMEM30B	Q3MIR4	351 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	C6orf201	Q7Z4U5	140 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR56B1	Q8NGI3	324 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR4P4	Q8NGL7	312 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR4K15	Q8NH41	348 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	NDNF	Q8TB73	568 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		13.34	□□□□□ -0.27
MIB2-223	ENST00000508148	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	C15orf65	H3BRN8	121 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	IGLV1-47	P01700	117 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CD28	P10747	220 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RAB6A	P20340	208 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	CEACAM3	P40198	252 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	PRRX1	P54821	245 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	LTC4S	Q16873	150 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	HLA-DRB5	Q30154	266 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	FBLN7	Q53RD9	439 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148		Q6ZS46	218 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148		Q8N2B8	174 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	ARL11	Q969Q4	196 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	HSF4	Q9ULV5	492 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	TCF19	Q9Y242	345 aa		13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.33	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	NOTCH3	Q9UM47	2321 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148		A6NDX4	124 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	VGLL3	A8MV65	326 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	C12orf77	C9JDV5	145 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SPINT2	O43291	252 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	SDC2	P34741	201 aa		13.32	□□□□□ -0.28
MIB2-223	ENST00000508148	VEGFC	P49767	419 aa		13.32	□□□□□ -0.28

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