RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 PDCD6O75340 191 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 PEX14O75381 377 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CSF1P09603 554 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 IGHV3-43DP0DP04 118 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 VSIG8P0DPA2 414 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 LOXL3P58215 753 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM91Q6ZNR0 172 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 OR56B4Q8NH76 319 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 GFOD1Q9NXC2 390 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 RAB26Q9ULW5 256 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 FBXO24O75426 580 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CA11O75493 328 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 GLAP06280 429 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CPEP16870 476 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 HTR2CP28335 458 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 RAB7AP51149 207 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TRAM1Q15629 374 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 NKAPLQ5M9Q1 402 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 C6orf183Q5T699 404 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 DRAM1Q8N682 238 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 MGLLQ99685 303 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM59Q9BXS4 323 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 WNT10AQ9GZT5 417 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 HSD17B6O14756 317 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 SLC22A1O15245 554 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 SPINT2O43291 252 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 HBZP02008 142 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 FAM106CPP0CH98 169 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CD28P10747 220 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CD37P11049 281 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 UNC119Q13432 240 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 ABCA11PQ4W5N1 156 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 OR8H3Q8N146 312 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 PRR18Q8N4B5 295 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 OR1L1Q8NH94 360 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 GFI1Q99684 422 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 BPNT1O95861 308 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 AMY1AP04745 511 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 AMY2AP04746 511 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CHATP28329 748 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TRAT1Q6PIZ9 186 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF367Q7RTV3 350 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 THNSL2Q86YJ6 484 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 LYG1Q8N1E2 194 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 LINC00311Q8N616 119 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 C8orf31Q8N9H6 132 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 OR10V1Q8NGI7 309 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 KCNG3Q8TAE7 436 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 NEDD4LQ96PU5 975 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 NICN1Q9BSH3 213 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 RAB9BQ9NP90 201 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 GNG12Q9UBI6 72 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 MOB4Q9Y3A3 225 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM14DPA8MWL7 114 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CCRL2O00421 344 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 SLC31A2O15432 143 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 ARL6IP5O75915 188 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 LPLP06858 475 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 CALRP27797 417 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 REG1BP48304 166 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 QRFPP83859 136 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 FABP5Q01469 135 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 HES1Q14469 280 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 P2RY14Q15391 338 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM30BQ3MIR4 351 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 Q3ZCU0 254 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 SULT4A1Q9BR01 284 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TM2D1Q9BX74 207 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 PLGRKTQ9HBL7 147 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TAF9BQ9HBM6 251 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 M0QZK8 103 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 SLC17A2O00624 439 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 WIPF1O43516 503 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 TMEM11P17152 192 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 IL3RAP26951 378 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 C6orf201Q7Z4U5 140 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF439Q8NDP4 499 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 ACOT13Q9NPJ3 140 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXD11-202ENST00000498438 A0A0A6YYD4 124 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms