RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495123.5

PKP4-216, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 5

Gene PKP4, Length 580 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-216ENST00000495123 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PECRQ9BY49 303 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 AK3Q9UIJ7 227 aa7.01□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 A0A1W2PPE3 182 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 H3BUI4 141 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RAB27BO00194 218 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ORC5O43913 435 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 CA11O75493 328 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 IGLV1-47P01700 117 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RAB6AP20340 208 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RPS19P39019 145 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RANBP1P43487 201 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PLA1AQ53H76 456 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 C6orf183Q5T699 404 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 IDNKQ5T6J7 187 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 Q6ZTK2 550 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PRR18Q8N4B5 295 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR56B1Q8NGI3 324 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR5H6Q8NGV6 325 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR1L1Q8NH94 360 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ZFAND2BQ8WV99 257 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SSMEM1Q8WWF3 244 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 CHIAQ9BZP6 476 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 MEGF9Q9H1U4 602 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HSF4Q9ULV5 492 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PSG11Q9UQ72 335 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 KCNK7Q9Y2U2 307 aa7□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 H3BUX3 64 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 J3QR06 171 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 F2RL2O00254 374 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 MFNGO00587 321 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 NAPSAO96009 420 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HBZP02008 142 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GNB3P16520 340 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HTR1DP28221 377 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SERPINB10P48595 397 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GNG10P50151 68 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 LOXL3P58215 753 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 VBP1P61758 197 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SSX2Q16385 188 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 MINOS1Q5TGZ0 78 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GPR107Q5VW38 600 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 C16orf87Q6PH81 154 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TMEM86BQ8N661 226 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR9G1Q8NH87 305 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 NDNFQ8TB73 568 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SETD6Q8TBK2 473 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ZNF596Q8TC21 504 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PIFOQ8TCI5 191 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PTX4Q96A99 478 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RAB3CQ96E17 227 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 MALSU1Q96EH3 234 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SSX3Q99909 188 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ATG5Q9H1Y0 275 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TAF9BQ9HBM6 251 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GFOD1Q9NXC2 390 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HILPDAQ9Y5L2 63 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa6.99□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 A0A075B6Q4 140 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 FAM181BA6NEQ2 426 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 LY6LH3BQJ8 138 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TOR1AO14656 332 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SLC31A2O15432 143 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 SPINT2O43291 252 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GABARAPO95166 117 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 RAB13P51153 203 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 PRRX1P54821 245 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 ACTG1P63261 375 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GNMTQ14749 295 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 HMGN3Q15651 99 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 FAM189A2Q15884 450 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 LY6EQ16553 131 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 CTF1Q16619 201 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 GPR141Q7Z602 305 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR52L2PQ8NGH6 319 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.98□□□□□ -1.29
PKP4-216ENST00000495123 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 892 ms