RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482597.5

PTPRVP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type V, pseudogene, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRVP, Length 3,999 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRVP-201ENST00000482597 CLEC18BQ6UXF7 455 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00518Q8N0U6 118 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 RPS4Y2Q8TD47 263 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 NABP1Q96AH0 204 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 ASCL3Q9NQ33 180 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 PSG11Q9UQ72 335 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 FRYLO94915 3013 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PPE3 182 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 J3QT63 122 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 ST8SIA3O43173 380 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 IL5P05113 134 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 HEXAP06865 529 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 CECR9P0C854 216 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 PRF1P14222 555 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 P2RY4P51582 365 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM50BP56557 158 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 RBM11P57052 281 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 P2RY6Q15077 328 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 DCAF12L2Q5VW00 463 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 COMMD1Q8N668 190 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 MDS2Q8NDY4 140 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF251Q9BRH9 671 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 FAM117AQ9C073 453 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 CCL28Q9NRJ3 127 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 DLL3Q9NYJ7 618 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 H7BYZ3 331 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 CTXN2P0C2S0 81 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 TMPRSS3P57727 454 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 MIDNQ504T8 468 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 SPANXN5Q5MJ07 72 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 BTNL3Q6UXE8 466 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 DBX2Q6ZNG2 339 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 C1orf87Q8N0U7 546 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 RPRMLQ8N4K4 120 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PRD5 423 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PRF3 423 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PRM7 423 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM14DPA8MWL7 114 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 AQP7O14520 342 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 DVL1O14640 695 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 FPR2P25090 351 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 GPR12P47775 334 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 RAB32Q13637 225 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 KRTCAP3Q53RY4 240 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC01560Q8TB33 94 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 OR2V2Q96R30 315 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 TAAR6Q96RI8 345 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 CXXC4Q9H2H0 198 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PPE2 198 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 LINC00862A6NCI5 91 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 WISP2O76076 250 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 HAND1O96004 215 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 RPL12P30050 165 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 SPINK9Q5DT21 86 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 STPG2Q8N412 459 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF383Q8NA42 475 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 C10orf35Q96D05 121 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 BTF3L4Q96K17 158 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 GHITMQ9H3K2 345 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRVP-201ENST00000482597 A0A1W2PPV4 95 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 TMEM218A2RU14 115 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 OR5H1A6NKK0 313 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 ZNF727A8MUV8 499 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 H0YL77 283 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 BCL2L11O43521 198 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 DFFBO76075 338 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 DTX1Q86Y01 620 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 SLC39A9Q9NUM3 307 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 V9GYS6 101 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 TUBAL3A6NHL2 446 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 PPYP01298 95 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 FCGR3AP08637 254 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 NMBP08949 121 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 CTSSP25774 331 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 PSG7Q13046 419 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 MPPED2Q15777 294 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 KCNMB1Q16558 191 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 GAPTQ8N292 157 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 ITLN1Q8WWA0 313 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 PRDM14Q9GZV8 571 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 HEYLQ9NQ87 328 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 DENND4AQ7Z401 1863 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 MPV17P39210 176 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 HGFACQ04756 655 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 C11orf87Q6NUJ2 197 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRVP-201ENST00000482597 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.1 ms