RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GZMHP20718 246 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 VDAC1P21796 283 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 PSMB8P28062 276 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CD1BP29016 333 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SOX6P35712 828 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SOX2P48431 317 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 NHLRC3Q5JS37 347 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 C8orf31Q8N9H6 132 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52M1Q8NGK5 317 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR52N1Q8NH53 320 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5AK2Q8NH90 309 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GATAD1Q8WUU5 269 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CCDC107Q8WV48 283 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 KCTD7Q96MP8 289 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RASL11BQ9BPW5 248 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SNTNA6NMZ2 147 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 EI24O14681 340 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MT-ND4P03905 459 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 IGF1P05019 195 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 IGHV3-43DP0DP04 118 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GABRB1P18505 474 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MYF6P23409 242 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 IL3RAP26951 378 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 VHLP40337 213 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF137PP52743 207 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 F2RL1P55085 397 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ASPHD1Q5U4P2 390 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR11H1Q8NG94 326 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8H1Q8NGG4 311 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MYOZ3Q8TDC0 251 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00476Q8WZB0 136 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 JAM3Q9BX67 310 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 KLK15Q9H2R5 256 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GNB4Q9HAV0 340 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 AMBNQ9NP70 447 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ERVK13-1Q9NX77 482 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 IL36GQ9NZH8 169 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF580Q9UK33 172 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ORC6Q9Y5N6 252 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.32□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 C12orf77C9JDV5 145 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ORC5O43913 435 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 FADS2O95864 444 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SERPINA2P20848 420 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 Q3ZCU0 254 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ATAD3CQ5T2N8 411 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 DDI2Q5TDH0 399 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF439Q8NDP4 499 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 NEK7Q8TDX7 302 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 PYDC1Q8WXC3 89 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MYCBPQ99417 103 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 METTL9Q9H1A3 318 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GNG12Q9UBI6 72 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ING4Q9UNL4 249 aa7.31□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1W2PP11 408 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 G3V318 75 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 I3L521 148 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 AIPO00170 330 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 TXNL1O43396 289 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LY6G6CO95867 125 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CD2P06729 351 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR8U8P0C7N1 319 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LIMS3P0CW19 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LIMS4P0CW20 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR5H8P0DN80 308 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 INSL3P51460 131 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ALDH3A2P51648 485 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF134P52741 427 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 GNB1P62873 340 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 PPP3R1P63098 170 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RUNX1Q01196 453 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF616Q08AN1 781 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 RAB40BQ12829 278 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LSAMPQ13449 338 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 MPV17LQ2QL34 196 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 CT45A1Q5HYN5 189 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 XAF1Q6GPH4 301 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00596Q86U02 117 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF491Q8N8L2 437 aa7.3□□□□□ -1.24
SMARCE1-210ENST00000481231 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.3□□□□□ -1.24
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