RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000479480.5

CTPS1-208, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTPS1, Length 777 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-208ENST00000479480 ELP2Q6IA86 826 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 C5orf24Q7Z6I8 188 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 AMIGO2Q86SJ2 522 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 Q8N1Y9 231 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 LINC00311Q8N616 119 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 MYOZ3Q8TDC0 251 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC107Q8WV48 283 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 CIB1Q99828 191 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 RASL11BQ9BPW5 248 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 ALX4Q9H161 411 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 AASSQ9UDR5 926 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 WSB1Q9Y6I7 421 aa6.54□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 MAGEA13PA6NCF6 341 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 E9PI62 339 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 GABRPO00591 440 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 SLC16A6O15403 523 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 MOSP00540 346 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 IGF1P05019 195 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 GZMHP20718 246 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 VDAC1P21796 283 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 SOX6P35712 828 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 TMED1Q13445 227 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 ATP6AP1Q15904 470 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 LPCAT4Q643R3 524 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 ASCL4Q6XD76 172 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 FAM220AQ7Z4H9 259 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 SATL1Q86VE3 508 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 PXT1Q8NFP0 134 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 OR51A2Q8NGJ7 313 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 OR8J1Q8NGP2 316 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 ARL11Q969Q4 196 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 RNFT2Q96EX2 444 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 PELI1Q96FA3 418 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 CYYR1Q96J86 154 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 GON7Q9BXV9 100 aa6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
CTPS1-208ENST00000479480 DAPL1A0PJW8 107 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 ATP8B1O43520 1251 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 SULT1B1O43704 296 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 CDRT1O95170 752 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 MT-ND4P03905 459 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 GP9P14770 177 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 CPEP16870 476 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 CNTFRP26992 372 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 RAB9AP51151 201 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 INSL3P51460 131 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 SLURP1P55000 103 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 RUNX1Q01196 453 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 PAX5Q02548 391 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF616Q08AN1 781 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 IL13RA2Q14627 380 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 KIR3DS1Q14943 382 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 CT45A1Q5HYN5 189 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 LHFPL3Q86UP9 236 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 PARP16Q8N5Y8 322 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 CCDC197Q8NCU1 140 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF439Q8NDP4 499 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 OR52M1Q8NGK5 317 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 CT45A3Q8NHU0 189 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 C4orf36Q96KX1 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 UBE2E2Q96LR5 201 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 RIBC2Q9H4K1 309 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 EDA2RQ9HAV5 297 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 PALMDQ9NP74 551 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 FAM118AQ9NWS6 357 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 ING4Q9UNL4 249 aa6.52□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 OVOL1O14753 267 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 GYG2O15488 501 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 RRP9O43818 475 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 SAP30O75446 220 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 OR8U8P0C7N1 319 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 MYF6P23409 242 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 KCNJ3P48549 501 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 ZNF529Q6P280 563 aa6.51□□□□□ -1.37
CTPS1-208ENST00000479480 TMEM65Q6PI78 240 aa6.51□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.4 ms