RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475451.1

MIA3-208, Transcript of MIA SH3 domain ER export factor 3, human

TSL 3

Gene MIA3, Length 552 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MIA3-208	ENST00000475451		Q8NFD4	153 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OR51T1	Q8NGJ9	327 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OR13F1	Q8NGS4	319 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	ZFAND2B	Q8WV99	257 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	S100A13	Q99584	98 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SLITRK2	Q9H156	845 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	MMP26	Q9NRE1	261 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	PTTG2	Q9NZH5	202 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	IL36RN	Q9UBH0	155 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	RPUSD1	Q9UJJ7	312 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	STUB1	Q9UNE7	303 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	MAB21L2	Q9Y586	359 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		4.13	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451		K7N7A8	449 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	PDCD5	O14737	125 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SH2D1B	O14796	132 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SLC22A1	O15245	554 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	ZNF737	O75373	536 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CDRT1	O95170	752 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OR2H2	O95918	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CLEC3B	P05452	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	UBB	P0CG47	229 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	ADRA2C	P18825	462 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	MYL9	P24844	172 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	LMO1	P25800	156 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	HTR2C	P28335	458 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FGF9	P31371	208 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	RANBP1	P43487	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CAPZA1	P52907	286 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	TWIST1	Q15672	202 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	AWAT2	Q6E213	333 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451		Q6P435	159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	GLIPR1L1	Q6UWM5	242 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	C1QL2	Q7Z5L3	287 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	TBC1D26	Q86UD7	250 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CADM3	Q8N126	398 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FGFRL1	Q8N441	504 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CHST4	Q8NCG5	386 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OR4D6	Q8NGJ1	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	MRPS24	Q96EL2	167 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	C1orf147	Q96MC9	270 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	GFI1	Q99684	422 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	BEX2	Q9BXY8	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	OPN4	Q9UHM6	478 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	ING4	Q9UNL4	249 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	KPTN	Q9Y664	436 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	AUP1	Q9Y679	476 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CUBN	O60494	3623 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FUOM	A2VDF0	154 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FAM90A8P	A6NJQ4	464 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451		M0R1W7	72 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SIRPB1	O00241	398 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SLC17A2	O00624	439 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	DEGS1	O15121	323 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	NOL3	O60936	208 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	SCGB1D1	O95968	90 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	CSN2	P05814	226 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	HOXB5	P09067	269 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FAM90A13P	P0C7W8	464 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FAM90A24P	P0C7X0	464 aa		4.11	□□□□□ -1.75
MIA3-208	ENST00000475451	FAM157C	P0CG43	387 aa		4.11	□□□□□ -1.75

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.2 ms