RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475319.1

ECHDC1-215, Transcript of ethylmalonyl-CoA decarboxylase 1, humanhuman

TSL 2

Gene ECHDC1, Length 1,543 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1-215ENST00000475319 C19orf35Q6ZS72 473 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 Q6ZVH6 145 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 Q6ZWC4 215 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PRSS45Q7RTY3 260 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 DTX2Q86UW9 622 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 TTC9CQ8N5M4 171 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ADAD2Q8NCV1 583 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 C16orf52Q8NHV5 167 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PCED1BQ96HM7 432 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ST6GALNAC5Q9BVH7 336 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SMIM3Q9BZL3 60 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 IKZF5Q9H5V7 419 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM206AQ9NX38 181 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 FLRT3Q9NZU0 649 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 KIAA1456Q9P272 454 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 MTFP1Q9UDX5 166 aa5.13□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SSC5DA1L4H1 1573 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A087WUU8 490 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GAGE12JA6NER3 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 A6NIN4 97 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR4C45A6NMZ5 311 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GRXCR1A8MXD5 290 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ANKRD66B4E2M5 251 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 DIRC3C9JPN6 131 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 M0R129 80 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 MLNRO43193 412 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GAGE7O76087 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SFT2D2O95562 160 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ETHE1O95571 254 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PPP1R3DO95685 299 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 COL4A1P02462 1669 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GAGE12FP0CL80 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GAGE12GP0CL81 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GAGE12IP0CL82 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 LIMS3P0CW19 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 LIMS4P0CW20 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 HIST1H1EP10412 219 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 CCKBRP32239 447 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF83P51522 516 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SEC61GP60059 68 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 RHOBP62745 196 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SEC11AP67812 179 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SIRPAP78324 504 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 RAE1P78406 368 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 EFEMP1Q12805 493 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GAGE4Q13068 117 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 KIR2DS1Q14954 304 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 EXOSC7Q15024 291 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR8B8Q15620 311 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 DCAF4L1Q3SXM0 396 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SYT14P1Q58G82 188 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ZNF506Q5JVG8 444 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 FAM162BQ5T6X4 162 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 CEACAM20Q6UY09 585 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 HIST2H2ABQ8IUE6 130 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC35F2Q8IXU6 374 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 GPD1LQ8N335 351 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ZDHHC22Q8N966 263 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ZIC4Q8N9L1 334 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR4C16Q8NGL9 310 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR5AR1Q8NGP9 310 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR9G4Q8NGQ1 327 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR2G3Q8NGZ4 309 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR4F5Q8NH21 305 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC25A43Q8WUT9 341 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 AQP3Q92482 292 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SLC25A38Q96DW6 304 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 WDR34Q96EX3 536 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PGLYRP2Q96PD5 576 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 DEFB118Q96PH6 123 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 UHRF2Q96PU4 802 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PRR25Q96S07 402 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 WDR61Q9GZS3 305 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PARLQ9H300 379 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 OR51I1Q9H343 314 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 EGLN3Q9H6Z9 239 aa5.12□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PQF6 199 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 A0A1W2PRE2 83 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 F5H768 121 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SAP18O00422 153 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 TAPBPO15533 448 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 ORM1P02763 201 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PFN1P07737 140 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PTHLHP12272 177 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 MMP9P14780 707 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 IGFBP2P18065 325 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 PGCP20142 388 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 SRP14P37108 136 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 P2RY1P47900 373 aa5.11□□□□□ -1.59
ECHDC1-215ENST00000475319 FOXG1P55316 489 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.3 ms