RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000475195.5

ATG4B-216, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 762 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-216ENST00000475195 FAAP24Q9BTP7 215 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 KCNK15Q9H427 330 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 STEAP1Q9UHE8 339 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PITPNC1Q9UKF7 332 aa13.25□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 IFITM5A6NNB3 132 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CHST1O43916 411 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RAB3BP20337 219 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 P2RY14Q15391 338 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM30BQ3MIR4 351 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 C6orf183Q5T699 404 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 C22orf42Q6IC83 251 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 C6orf201Q7Z4U5 140 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LEAP2Q969E1 77 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RAB9BQ9NP90 201 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ABCB10Q9NRK6 738 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 GFOD1Q9NXC2 390 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 HSF4Q9ULV5 492 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 STUB1Q9UNE7 303 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RNF114Q9Y508 228 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa13.24□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SOCS1O15524 211 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NAPSAO96009 420 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 MYL9P24844 172 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CLDN12P56749 244 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PLA1AQ53H76 456 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 STEAP3Q658P3 488 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF880Q6PDB4 577 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TPRA1Q86W33 373 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NR2C2APQ86WQ0 139 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 DTX3Q8N9I9 347 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OCSTAMPQ9BR26 566 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RAB22AQ9UL26 194 aa13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP13.23□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 HAX1O00165 279 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SPINT2O43291 252 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 BRS3P32247 399 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OR10A3P58181 314 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LTC4SQ16873 150 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 HES5Q5TA89 166 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 THNSL2Q86YJ6 484 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 Q8N2B8 174 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 WFDC12Q8WWY7 111 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PTX4Q96A99 478 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TAF9BQ9HBM6 251 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SSR3Q9UNL2 185 aa13.22□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 RRP9O43818 475 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 TNFAIP8O95379 198 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 IGHV3-7P01780 117 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 HBZP02008 142 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF134P52741 427 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 EFNB2P52799 333 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 KRTAP10-3P60369 221 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 HTD2P86397 168 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 MADCAM1Q13477 382 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NKAPLQ5M9Q1 402 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 LY6G6FQ5SQ64 297 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF439Q8NDP4 499 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OR56B1Q8NGI3 324 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OR1L1Q8NH94 360 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 SGMS2Q8NHU3 365 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 CITED1Q99966 193 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 NPFFR1Q9GZQ6 430 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 OR51E2Q9H255 320 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 KCNIP1Q9NZI2 227 aa13.21□□□□□ -0.29
ATG4B-216ENST00000475195 A0A087WXM4 84 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 TRIM64CA6NLI5 447 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 RAB6AP20340 208 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 MNDAP41218 407 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 VEGFCP49767 419 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 RAB7AP51149 207 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 ARHGDIBP52566 201 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 PLA2G7Q13093 441 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 C11orf88Q6PI97 169 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 Q6ZPA2 131 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 Q6ZTK2 550 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 C16orf82Q7Z2V1 217 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 UBALD1Q8TB05 177 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 CFHR4Q92496 578 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 ZNF696Q9H7X3 374 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa13.2□□□□□ -0.3
ATG4B-216ENST00000475195 NOTOA8MTQ0 251 aa13.19□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.1 ms