RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 MRPL2Q5T653 305 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 LCE1FQ5T754 118 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6ZRU5 148 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 TCF23Q7RTU1 214 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 MFSD8Q8NHS3 518 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 PHOSPHO2Q8TCD6 241 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 REEP6Q96HR9 211 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51I1Q9H343 314 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00527Q9UJ94 153 aa3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP3.87□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 GMNCA6NCL1 334 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 POP7O75817 140 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 REG1AP05451 166 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 CRYBA1P05813 215 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A2P29034 98 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 SULT1A1P50225 295 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 GLO1Q04760 184 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 IHHQ14623 411 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST3H3Q16695 136 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 SPIN3Q5JUX0 258 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM104BQ5XKR9 115 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 OR10K2Q6IF99 312 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 LAIR2Q6ISS4 152 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 NT5DC3Q86UY8 548 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 NIT1Q86X76 327 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 NATD1Q8N6N6 113 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 OR7D2Q96RA2 312 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 RNF5Q99942 180 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 SLC22A7Q9Y694 548 aa3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP3.86□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 SVILO95425 2214 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF708P17019 499 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 CNTFRP26992 372 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 REG1BP48304 166 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 OR4D2P58180 307 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 GABARAPL2P60520 117 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 NAA20P61599 178 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ARF6P62330 175 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 EBPQ15125 230 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 SPA17Q15506 151 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 LCN8Q6JVE9 175 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 IGFL2Q6UWQ7 119 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ZFP2Q6ZN57 461 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 Q8N7P7 452 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM75Q8N9X5 138 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 OR51H1Q8NH63 302 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 GALMQ96C23 342 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 DOCK9Q9BZ29 2069 aa3.85□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF646O15015 1829 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 CROCCQ5TZA2 2017 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 IZUMO1RA6ND01 250 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ARGFXA6NJG6 315 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 F5H5P2 479 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 CDRT1O95170 752 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 OR5AC1P0C628 307 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 CISD3P0C7P0 127 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 NTF3P20783 257 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMB3P49720 205 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 TAF6P49848 677 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCA11PQ4W5N1 156 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 PRSS54Q6PEW0 395 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 CYHR1Q6ZMK1 362 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 OR8S1Q8NH09 359 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 TMA16Q96EY4 203 aaKnown RBP3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ACY3Q96HD9 319 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 PEBP4Q96S96 227 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 PECRQ9BY49 303 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 GNB1LQ9BYB4 327 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 HES4Q9HCC6 221 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 VPS29Q9UBQ0 182 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa3.84□□□□□ -1.79
RABGGTB-209ENST00000473406 C5orf49A4QMS7 147 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 CLDN24A6NM45 220 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 B4DEV8 164 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 IGHV1-46P01743 117 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 OR13C7P0DN81 318 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 OR12D1P0DN82 309 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 ALOX5APP20292 161 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 DDTP30046 118 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 NOVP48745 357 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 HES3Q5TGS1 186 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 EBLN2Q6P2I7 272 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 NEGR1Q7Z3B1 354 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 ATP5L2Q7Z4Y8 100 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 STX12Q86Y82 276 aa3.83□□□□□ -1.8
RABGGTB-209ENST00000473406 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa3.83□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.9 ms