RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473257.1

ACTB-209, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 3

Gene ACTB, Length 556 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-209ENST00000473257 FHL3Q13643 280 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GNMTQ14749 295 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SLC22A6Q4U2R8 563 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A30Q5SVS4 291 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ASCL4Q6XD76 172 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 CBR4Q8N4T8 237 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 FAM71E2Q8N5Q1 922 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 RNF152Q8N8N0 203 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 Q8NFD4 153 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 OR4K15Q8NH41 348 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 C4orf3Q8WVX3 66 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 TRUB1Q8WWH5 349 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 JAM3Q9BX67 310 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 GMPPBQ9Y5P6 360 aa8.72□□□□□ -1.01
ACTB-209ENST00000473257 H3BNX3 289 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 AIPO00170 330 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MAGEB3O15480 346 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ELANEP08246 267 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LIMS3P0CW19 117 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LIMS4P0CW20 117 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GZMHP20718 246 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PSMB8P28062 276 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CD1BP29016 333 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SOX6P35712 828 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PAX5Q02548 391 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CASC10Q5T4H9 136 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 DDI2Q5TDH0 399 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR2G6Q5TZ20 316 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MEDAGQ5VYS4 303 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF497Q6ZNH5 498 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 HAPLN4Q86UW8 402 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SYS1Q8N2H4 156 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LINC00311Q8N616 119 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF439Q8NDP4 499 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR10A7Q8NGE5 316 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR1N2Q8NGR9 330 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MUC7Q8TAX7 377 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 DCUN1D4Q92564 292 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RCHY1Q96PM5 261 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 METTL9Q9H1A3 318 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PARP11Q9NR21 331 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GNG12Q9UBI6 72 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 A0A1W2PPK0 400 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 C3orf84H3BNL1 204 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 I3L521 148 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ATP6V0E1O15342 81 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LALBAP00709 142 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 HBZP02008 142 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 KCNJ3P48549 501 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ETV1P50549 477 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SLURP1P55000 103 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZFAND6Q6FIF0 208 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SLC25A48Q6ZT89 311 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZFP41Q8N8Y5 198 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR52L2PQ8NGH6 319 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 APH1BQ8WW43 257 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TMEM106AQ96A25 262 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SLC29A1Q99808 456 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MRPL20Q9BYC9 149 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 BANF2Q9H503 90 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ISYNA1Q9NPH2 558 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ORC6Q9Y5N6 252 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 UBE2QL1A1L167 161 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 RRP9O43818 475 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 FADS2O95864 444 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 SPNP16150 400 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IL3RAP26951 378 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 PPP1CCP36873 323 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR3A3P47888 321 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ALDH3A2P51648 485 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 NDPQ00604 133 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 LSAMPQ13449 338 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MMDQ15546 238 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 NHLRC3Q5JS37 347 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF491Q8N8L2 437 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 OR52M1Q8NGK5 317 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MYOZ3Q8TDC0 251 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 GPR148Q8TDV2 347 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MUL1Q969V5 352 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 MRPL48Q96GC5 212 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 IFT22Q9H7X7 185 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-209ENST00000473257 TMEM138Q9NPI0 162 aa8.69□□□□□ -1.02
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