RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469947.5

SH3BP1-206, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,612 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-206ENST00000469947 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP11.59□□□□□ -0.55
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SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM54Q969K7 222 aa11.59□□□□□ -0.55
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SH3BP1-206ENST00000469947 IGKV1-33P01594 117 aa11.56□□□□□ -0.56
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SH3BP1-206ENST00000469947 RAB4AP20338 218 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 TDGF1P3P51864 188 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 ERVFC1-1P60608 527 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 TMEM241Q24JQ0 296 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 ACSF3Q4G176 576 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 FAM27BQ5VT28 67 aa11.56□□□□□ -0.56
SH3BP1-206ENST00000469947 ZNF525Q8N782 197 aa11.56□□□□□ -0.56
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SH3BP1-206ENST00000469947 DEFB126Q9BYW3 111 aa11.56□□□□□ -0.56
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