RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 RBFOX3A6NFN3 312 aa15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 S100A6P06703 90 aa15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 VASH2Q86V25 355 aa15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ATP5SQ99766 215 aa15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 IFT22Q9H7X7 185 aa15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RNF115Q9Y4L5 304 aa15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 FAM186AA6NE01 2351 aa15.58■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 LRP5LA4QPB2 252 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ARGFXA6NJG6 315 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 IFNA4P05014 189 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CD59P13987 128 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 MDH2P40926 338 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SULT1A1P50225 295 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RUNX1Q01196 453 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SHEQ5VZ18 495 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A24Q6NUK1 477 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ODF3L1Q8IXM7 274 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 OR1A1Q9P1Q5 309 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TNFSF15O95150 251 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 MOB1BQ7L9L4 216 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 P4HA3Q7Z4N8 544 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GPR146Q96CH1 333 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 R4GN57 208 aa15.57■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0G2JRQ6 117 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PPH5 198 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 H3BP45 60 aa15.56■□□□□ 0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 DFFBO76075 338 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CNOT4O95628 575 aaKnown RBP15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SLC25A6P12236 298 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CCL20P78556 96 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 Q8IYB0 196 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF561Q8N587 486 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 KIAA1456Q9P272 454 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 KNTC1P50748 2209 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 DOCK7Q96N67 2140 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A6NLC8 198 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 PAX9P55771 341 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RAB2AP61019 212 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TLE4Q04727 773 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TGIF1Q15583 401 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 IGFBP7Q16270 282 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 DHRS13Q6UX07 377 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 WDYHV1Q96HA8 205 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RAB40CQ96S21 281 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 COA4Q9NYJ1 87 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TREM2Q9NZC2 230 aa15.56■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 IFNA5P01569 189 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SP9P0CG40 484 aa15.55■□□□□ 0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 SPSB3Q6PJ21 355 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 KCNS2Q9ULS6 477 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GPR179Q6PRD1 2367 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 MED13Q9UHV7 2174 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TRAV39A0A0B4J263 110 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 NPIPB11E5RHQ5 1161 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 OR2H2O95918 312 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ARG1P05089 322 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CEBPGP53567 150 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 HAGHQ16775 308 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 BCL2L14Q9BZR8 327 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 GP6Q9HCN6 339 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa15.55■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 J3QW42 95 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CEACAM1P13688 526 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
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SYNE4-204ENST00000465425 OR2J1Q9GZK6 312 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PPE2 198 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TXNL1O43396 289 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 NXPH2O95156 264 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 RAB5AP20339 215 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TAS2R30P59541 319 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 PPP1CBP62140 327 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF766Q5HY98 468 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF497Q6ZNH5 498 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CDH20Q9HBT6 801 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 SPRR3Q9UBC9 169 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CACNG5Q9UF02 275 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 WSB1Q9Y6I7 421 aa15.54■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP15.53■□□□□ 0.08
SYNE4-204ENST00000465425 HBE1P02100 147 aa15.53■□□□□ 0.08
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