RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 C1orf196B1AJZ1 125 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 B4DEV8 164 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM157AC9JC47 383 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 K7N7A8 449 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NUPL2O15504 423 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGHG3P01860 377 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SCTP09683 121 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MAS1LP35410 378 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SULT1A1P50225 295 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 AKR1C2P52895 323 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ERVK11-1P61568 191 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HBG1P69891 147 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HBG2P69892 147 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SERF2P84101 59 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 AKR1C1Q04828 323 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF616Q08AN1 781 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 DAZAP2Q15038 168 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGFBP7Q16270 282 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V1FQ16864 119 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF766Q5HY98 468 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 BRICD5Q6PL45 260 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 P4HA3Q7Z4N8 544 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SPACA3Q8IXA5 215 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM169BQ8N8A8 192 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR11L1Q8NGX0 322 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR2G3Q8NGZ4 309 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PINX1Q96BK5 328 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ATP5SQ99766 215 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SMIM3Q9BZL3 60 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CFAP54Q96N23 3096 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CACNA1AO00555 2505 aa7.25□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WWC5 75 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CXorf65A6NEN9 183 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RBFOX3A6NFN3 312 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IFNL4K9M1U5 179 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TGOLN2O43493 480 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ADAM20O43506 726 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IGHV3-9P01782 118 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HSPB1P04792 205 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF44P15621 663 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CBR1P16152 277 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PPP1CBP62140 327 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ARG2P78540 354 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 S100A12P80511 92 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NHLH2Q02577 135 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CLINT1Q14677 625 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 KHDC3LQ587J8 217 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SOHLH1Q5JUK2 328 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SLC35E4Q6ICL7 350 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 Q6P435 159 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF497Q6ZNH5 498 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 LINC00696Q6ZRV3 163 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 C17orf78Q8N4C9 275 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 OR8U1Q8NH10 309 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PRR7Q8TB68 274 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MALSU1Q96EH3 234 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TCEAL7Q9BRU2 100 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 WFDC1Q9HC57 220 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RAB9BQ9NP90 201 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CCL28Q9NRJ3 127 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TAAR3PQ9P1P4 343 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IL17BQ9UHF5 180 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 RAXQ9Y2V3 346 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NCKAP5O14513 1909 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 KNTC1P50748 2209 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 FAM24AA6NFZ4 105 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 COLCA2A8K830 154 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 MASP2O00187 686 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 SYNGR1O43759 233 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CHST1O43916 411 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 IL18BPO95998 194 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NGFP01138 241 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 S100A8P05109 93 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CELA3AP09093 270 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PGA5P0DJD9 388 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PTAFRP25105 342 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 ATP6V0CP27449 155 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HOXC12P31275 282 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 WNT5AP41221 380 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 NPBWR1P48145 328 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PPT1P50897 306 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 PAX5Q02548 391 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 CATR1Q13166 79 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 HERPUD1Q15011 391 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-208ENST00000464611 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.1 ms