RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460132.5

PLOD3-208, Transcript of procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 3, human

TSL 3

Gene PLOD3, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLOD3-208	ENST00000460132	SRM	P19623	302 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	CRHBP	P24387	322 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	RBM48	Q5RL73	367 aa	Known RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	C1orf100	Q5SVJ3	147 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	OR10K2	Q6IF99	312 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	GAPT	Q8N292	157 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	OR4K15	Q8NH41	348 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	UFD1	Q92890	307 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	CITED2	Q99967	270 aa	Predicted RBP	11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	VCX3B	Q9H321	246 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		11.65	□□□□□ -0.54
PLOD3-208	ENST00000460132	MPIG6B	O95866	241 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	GLA	P06280	429 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	UCHL1	P09936	223 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	UBB	P0CG47	229 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	VSIG8	P0DPA2	414 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CD37	P11049	281 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	RCC1	P18754	421 aa	Predicted RBP	11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	RAB7A	P51149	207 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	TPBG	Q13641	420 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	HSD17B12	Q53GQ0	312 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	IZUMO2	Q6UXV1	221 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	LINC00311	Q8N616	119 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	OR5AU1	Q8NGC0	362 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CCDC90B	Q9GZT6	254 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CST11	Q9H112	138 aa		11.64	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	ADARB2-AS1	A8MUL3	147 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	HSD17B6	O14756	317 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	SPINT2	O43291	252 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	PDCD6	O75340	191 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CA11	O75493	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	HBZ	P02008	142 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	GAPDH	P04406	335 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	MAP2K4	P45985	399 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	REG1B	P48304	166 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	EMX1	Q04741	257 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	HES1	Q14469	280 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	HNF4G	Q14541	408 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	C6orf183	Q5T699	404 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	PRSS48	Q7RTY5	328 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CENPV	Q7Z7K6	275 aa	Predicted RBP	11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	PRR18	Q8N4B5	295 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	OR1L1	Q8NH94	360 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	ISYNA1	Q9NPH2	558 aa		11.63	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132		M0QZK8	103 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CCRL2	O00421	344 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC22A1	O15245	554 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC31A2	O15432	143 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	OPN1MW	P04001	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	OPN1MW2	P0DN77	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	OPN1MW3	P0DN78	364 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CPE	P16870	476 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	TMEM11	P17152	192 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	HTR2C	P28335	458 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	HSPA13	P48723	471 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF134	P52741	427 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	C9orf152	Q5JTZ5	239 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	C5orf24	Q7Z6I8	188 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	MOB3B	Q86TA1	216 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	C1QL4	Q86Z23	238 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CNBD2	Q96M20	576 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	KCNK15	Q9H427	330 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	GNG12	Q9UBI6	72 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	MOB4	Q9Y3A3	225 aa		11.62	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	IGHV3-72	A0A0B4J1Y9	119 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	IGHV1-3	A0A0C4DH29	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	IGKV1D-33	P01593	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	IGKV1-33	P01594	117 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CHAT	P28329	748 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	QRFP	P83859	136 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CD83	Q01151	205 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	UNC119	Q13432	240 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132		Q3ZCU0	254 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	TRAT1	Q6PIZ9	186 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	SLC25A48	Q6ZT89	311 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	MRPL30	Q8TCC3	161 aa	Known RBP	11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	GFI1	Q99684	422 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	MGLL	Q99685	303 aa		11.61	□□□□□ -0.55
PLOD3-208	ENST00000460132	SULT4A1	Q9BR01	284 aa		11.61	□□□□□ -0.55

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