RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CASP3P42574 277 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GPD2P43304 727 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MTPNP58546 118 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HERVK_113P61574 105 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RPL30P62888 115 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NUCB1Q02818 461 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TUBB3Q13509 450 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 EDDM3AQ14507 147 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR1Q1Q15612 314 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TNXAQ16473 311 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 DEFB116Q30KQ4 102 aa-2.64□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 AKIRIN2Q53H80 203 aa-2.64□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 ACSM2BQ68CK6 577 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MZT2AQ6P582 158 aa-2.64□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 LMBR1LQ6UX01 489 aa-2.64□□□□□ -2.83
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SNORD54-201ENST00000459159 TEX43Q6ZNM6 134 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 UBE2R2Q712K3 238 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HS2ST1Q7LGA3 356 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ADCK2Q7Z695 626 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ADAT2Q7Z6V5 191 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MON1AQ86VX9 555 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NIT1Q86X76 327 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BLIDQ8IZY5 108 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NDUFAF2Q8N183 169 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LINC00269Q8N2A0 174 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MMGT1Q8N4V1 131 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NATD1Q8N6N6 113 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 METTL13Q8N6R0 699 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NIPA2Q8N8Q9 360 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CYB561A3Q8NBI2 242 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TTLQ8NG68 377 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR4C5Q8NGB2 326 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR2D3Q8NGH3 330 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC8CQ8TDW0 803 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PTPMT1Q8WUK0 201 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 HSPH1Q92598 858 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LRRC45Q96CN5 670 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RAB3CQ96E17 227 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MVB12AQ96EY5 273 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 AK7Q96M32 723 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SH3GL3Q99963 347 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 C7orf50Q9BRJ6 194 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TMEM109Q9BVC6 243 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LDHAL6BQ9BYZ2 381 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP-2.64□□□□□ -2.831e-14■□□□□ 8.1
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SNORD54-201ENST00000459159 FAM153AQ9UHL3 310 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MOB4Q9Y3A3 225 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SNX8Q9Y5X2 465 aa-2.64□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CLIP1P30622 1438 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 A0A087WWV3 80 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR2AT4A6NND4 320 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01619G3V211 115 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 H0Y8X5 98 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GPR171O14626 319 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BET1O15155 118 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 INE1O15225 51 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR1F1O43749 312 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MAFKO60675 156 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 KRASP01116 189 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SERPINA5P05154 406 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GIPP09681 153 aaPredicted RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SULT1A3P0DMM9 295 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SULT1A4P0DMN0 295 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SPI1P17947 270 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 FOXN2P32314 431 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 GCKP35557 465 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 AHRP35869 848 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 OR3A2P47893 321 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 ENTPD1P49961 510 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 IDH3AP50213 366 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 KIF11P52732 1056 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RARSP54136 660 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 SMARCB1Q12824 385 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TAF10Q12962 218 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 PPP1R1AQ13522 171 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 FLOT2Q14254 428 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MESDQ14696 234 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 MED22Q15528 200 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 TAF12Q16514 161 aa-2.65□□□□□ -2.83
SNORD54-201ENST00000459159 BEX5Q5H9J7 111 aa-2.65□□□□□ -2.83
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