RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 Q6P435 159 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 TCF23Q7RTU1 214 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 LAX1Q8IWV1 398 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 Q8N2B8 174 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 OSR2Q8N2R0 312 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 SAMD12Q8N8I0 201 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 CHST4Q8NCG5 386 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 OR13D1Q8NGV5 346 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 NEK7Q8TDX7 302 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 C17orf50Q8WW18 174 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 DPF1Q92782 380 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 FAM46BQ96A09 425 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 AJUBAQ96IF1 538 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 SPATA2Q9UM82 520 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 ST3GAL6Q9Y274 331 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 PEX16Q9Y5Y5 336 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 ETV7Q9Y603 341 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 LINC00312Q9Y6C7 94 aa9.41□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PP11 408 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 FAM172BPA6NC97 362 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 FAM25AB3EWG3 89 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 FAM25CB3EWG5 89 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 FAM25GB3EWG6 89 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 F2RL2O00254 374 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 UBBP0CG47 229 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 IGHV1-8P0DP01 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 VSIG8P0DPA2 414 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 CD28P10747 220 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 PAX6P26367 422 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 RANBP1P43487 201 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 DLX6P56179 175 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 RBM11P57052 281 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 IL13RA2Q14627 380 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 ELP2Q6IA86 826 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 WFDC9Q8NEX5 89 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 MIXL1Q9H2W2 232 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 BANF2Q9H503 90 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 GHRLQ9UBU3 117 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 ZMAT5Q9UDW3 170 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 ADAM30Q9UKF2 790 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 TCF19Q9Y242 345 aa9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 TBL2Q9Y4P3 447 aaKnown RBP9.4□□□□□ -0.9
PRAME-210ENST00000442481 MEIKINA0A087WXM9 373 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TRAV24A0A0B4J272 114 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ODAMA1E959 279 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 C17orf98A8MV24 154 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CHST1O43916 411 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 PF4P02776 101 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 GTF2F2P13984 249 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 LMO1P25800 156 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ERP29P30040 261 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 SCAND1P57086 179 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 UNC119Q13432 240 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 MADCAM1Q13477 382 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 UBE2NLQ5JXB2 153 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 LYG1Q8N1E2 194 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 C11orf42Q8N5U0 333 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TMEM104Q8NE00 496 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 OR51T1Q8NGJ9 327 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 SLC25A38Q96DW6 304 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 COQ2Q96H96 371 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 AKR1E2Q96JD6 320 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TSC22D3Q99576 134 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CST11Q9H112 138 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ATG5Q9H1Y0 275 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ZNF702PQ9H963 129 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 SERTAD4Q9NUC0 356 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 RHBDL2Q9NX52 303 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 SESN1Q9Y6P5 492 aa9.39□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 LDLRAD4O15165 306 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 APOA1P02647 267 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 RBP4P02753 201 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 MGMTP16455 207 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 ELK1P19419 428 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 RAB6AP20340 208 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CDK2P24941 298 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 NFYBP25208 207 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 TNFSF8P32971 234 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 QRFPP83859 136 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 CD69Q07108 199 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 GPR176Q14439 515 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 LTC4SQ16873 150 aa9.38□□□□□ -0.91
PRAME-210ENST00000442481 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.6 ms