RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438265.5

RPE-211, Transcript of ribulose-5-phosphate-3-epimerase, humanhuman

TSL 3

Gene RPE, Length 668 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE-211ENST00000438265 C2orf76Q3KRA6 126 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 OR5R1Q8NH85 324 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ZDHHC16Q969W1 377 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 KIRREL1Q96J84 757 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 CLEC7AQ9BXN2 247 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 DPAGT1Q9H3H5 408 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SIGLEC9Q9Y336 463 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 FAM96BQ9Y3D0 163 aa6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MEIOCA2RUB1 952 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 BTBD17A6NE02 478 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SPINT2O43291 252 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 NAPSAO96009 420 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 PAHP00439 452 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MT-ND4P03905 459 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 CDK2P24941 298 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 CEACAM3P40198 252 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ALDH3B2P48448 385 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 DYNLT3P51808 116 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 LY6G6FQ5SQ64 297 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 HES5Q5TA89 166 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 STEAP3Q658P3 488 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ZNF880Q6PDB4 577 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 BRICD5Q6PL45 260 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 Q6ZTK2 550 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 OR9G1Q8NH87 305 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MALSU1Q96EH3 234 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 FUNDC2Q9BWH2 189 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 C12orf4Q9NQ89 552 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 RNF114Q9Y508 228 aa6.69□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 A0A0A6YYD4 124 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 C15orf65H3BRN8 121 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 RAB27BO00194 218 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 IGLV1-47P01700 117 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ARG1P05089 322 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SSTR5P35346 364 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 VEGFCP49767 419 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 PRRX1P54821 245 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 CLDN12P56749 244 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 HTD2P86397 168 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 HMGN3Q15651 99 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 OR10K2Q6IF99 312 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 GPR141Q7Z602 305 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ABHD12Q8N2K0 398 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 LINC00311Q8N616 119 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 DTX3Q8N9I9 347 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 OR4P4Q8NGL7 312 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 OR10R2Q8NGX6 335 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 OR4F5Q8NH21 305 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ARL11Q969Q4 196 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SLC25A46Q96AG3 418 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 RAB3CQ96E17 227 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 CMTM3Q96MX0 182 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SULT4A1Q9BR01 284 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 NICN1Q9BSH3 213 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MMP28Q9H239 520 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 RAB18Q9NP72 206 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 KCNIP1Q9NZI2 227 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 DAPK2Q9UIK4 370 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 JPT1Q9UK76 154 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SPATA2Q9UM82 520 aa6.68□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 LEUTXA8MZ59 168 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 G3V4G9 280 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 MFNGO00587 321 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 ITGB1BP1O14713 200 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 SOCS1O15524 211 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 TXNL1O43396 289 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 RGS11O94810 467 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 TFAP2AP05549 437 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 COX7A1P24310 79 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 HTR1DP28221 377 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 RPL5P46777 297 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 TMEM50BP56557 158 aa6.67□□□□□ -1.34
RPE-211ENST00000438265 PITPNAQ00169 270 aa6.67□□□□□ -1.34
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