RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428918.1

CDH23-AS1-201, CDH23 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CDH23-AS1, Length 378 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SERTAD4Q9NUC0 356 aa13.01□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV3-43A0A0B4J1X8 118 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1W2PPE3 182 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CCRL2O00421 344 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HSD17B6O14756 317 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ATP6V1G2O95670 118 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV3-43DP0DP04 118 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CPEP16870 476 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM11P17152 192 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VHLP40337 213 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TPBGQ13641 420 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABCA11PQ4W5N1 156 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C9orf152Q5JTZ5 239 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 UTF1Q5T230 341 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRTM1Q86UE6 522 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LYPD6Q86Y78 171 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GFOD1Q9NXC2 390 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MOB4Q9Y3A3 225 aa13□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C12orf77C9JDV5 145 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C15orf65H3BRN8 121 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SC5DO75845 299 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 VSIG8P0DPA2 414 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MAP2K4P45985 399 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPS25P62851 125 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF367Q7RTV3 350 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 MOB3BQ86TA1 216 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DRAM1Q8N682 238 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CFHR4Q92496 578 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OCSTAMPQ9BR26 566 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ACOT13Q9NPJ3 140 aa12.99□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 A0A1W2PPI3 338 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BPNT1O95861 308 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HBZP02008 142 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CALRP27797 417 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 REG1BP48304 166 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NSUN5P1Q3KNT7 163 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM95Q3KNT9 176 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q3ZCU0 254 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR10K2Q6IF99 312 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 THNSL2Q86YJ6 484 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SVOPQ8N4V2 548 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 C8orf31Q8N9H6 132 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TAF9BQ9HBM6 251 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ABRACLQ9P1F3 81 aa12.98□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC22A1O15245 554 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGKV1D-33P01593 117 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGKV1-33P01594 117 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CD28P10747 220 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ARSBP15848 533 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PSMD7P51665 324 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GP2P55259 537 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RAB11BQ15907 218 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 Q6ZS46 218 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 ZNF554Q86TJ5 538 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LINC00311Q8N616 119 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR10V1Q8NGI7 309 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR2S2Q9NQN1 319 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TXNL1O43396 289 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 RGS11O94810 467 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 CHATP28329 748 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LOXL3P58215 753 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GABARAPL2P60520 117 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 HNF4GQ14541 408 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 P2RY14Q15391 338 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SIGIRRQ6IA17 410 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TMEM91Q6ZNR0 172 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR2W3Q7Z3T1 314 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LYG1Q8N1E2 194 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GAPTQ8N292 157 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR4F17Q8NGA8 305 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR5AU1Q8NGC0 362 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR4X2Q8NGF9 303 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR1L1Q8NH94 360 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SETD6Q8TBK2 473 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 GALMQ96C23 342 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 OR4F4Q96R69 305 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 WNT10AQ9GZT5 417 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 LRRC42Q9Y546 428 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa12.96□□□□□ -0.33
CDH23-AS1-201ENST00000428918 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa12.95□□□□□ -0.34
CDH23-AS1-201ENST00000428918 SLC17A2O00624 439 aa12.95□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms