RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428007.1

PAICSP3-201, Transcript of phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, phosphoribosylaminoimidazole succinocarboxamide synthetase pseudogene 3, humanhuman

BASIC

Gene PAICSP3, Length 1,168 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAICSP3-201ENST00000428007 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 SAA4P35542 130 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 KIR2DS4P43632 304 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 SERPINB10P48595 397 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 RAB7AP51149 207 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 QRFPP83859 136 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNF273Q14593 569 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 KIR2DS1Q14954 304 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ATXN7L3Q14CW9 347 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 NEDD8Q15843 81 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 C2orf76Q3KRA6 126 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM27D1Q5T7N8 215 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 C22orf42Q6IC83 251 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 Q6ZTK2 550 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ACOT12Q8WYK0 555 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM46BQ96A09 425 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 GALMQ96C23 342 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 COQ2Q96H96 371 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 CALYQ9NYX4 217 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ZNRD1Q9P1U0 126 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 KIF25Q9UIL4 384 aa7.25□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM89A2RUT3 159 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 F2RL2O00254 374 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ITGB1BP1O14713 200 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 TPPPO94811 219 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 NDUFA7O95182 113 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ARG1P05089 322 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 MELTFP08582 738 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 HKR1P10072 659 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 CCL3L1P16619 93 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 CHATP28329 748 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 LSAMPQ13449 338 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 MADCAM1Q13477 382 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 INSL4Q14641 139 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 SLC9A3R2Q15599 337 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 DEFB112Q30KQ8 113 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 OR8H3Q8N146 312 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 BATF2Q8N1L9 274 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 PNKDQ8N490 385 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 LINC00311Q8N616 119 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ZDHHC22Q8N966 263 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 TMEM104Q8NE00 496 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 OR51D1Q8NGF3 324 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 OR4F5Q8NH21 305 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 C15orf40Q8WUR7 153 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 AP3S1Q92572 193 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ARL11Q969Q4 196 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ORAI1Q96D31 301 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 RAB3CQ96E17 227 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 LPAR5Q9H1C0 372 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 DCSTAMPQ9H295 470 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 BANF2Q9H503 90 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 C12orf4Q9NQ89 552 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 DIABLOQ9NR28 239 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 IL36RNQ9UBH0 155 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 JPT1Q9UK76 154 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 VPREB3Q9UKI3 123 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 MMP24Q9Y5R2 645 aa7.24□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM181BA6NEQ2 426 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 J3QR06 171 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 LDLRAD4O15165 306 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 YPEL1O60688 119 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 VENTXO95231 258 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 IGLV1-47P01700 117 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 CTXN2P0C2S0 81 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM106CPP0CH98 169 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 RPL11P62913 178 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 ACTG1P63261 375 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 HLA-DRB5Q30154 266 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 HCP5Q6MZN7 132 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 FAM71F2Q6NXP2 309 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 SFXN4Q6P4A7 337 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 Q6ZS49 121 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 RNF144BQ7Z419 303 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 OR10R2Q8NGX6 335 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 CAPSLQ8WWF8 208 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 KIRREL1Q96J84 757 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 YPEL2Q96QA6 119 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 SSX3Q99909 188 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 MMP28Q9H239 520 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 BEX1Q9HBH7 125 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 RABL2BQ9UNT1 228 aa7.23□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 A0A0U1RQK1 487 aa7.22□□□□□ -1.25
PAICSP3-201ENST00000428007 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69.8 ms