RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403441.1

PRAME-204, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3

Gene PRAME, Length 567 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-204ENST00000403441 FAM90A15PP0C7V4 464 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 FAM90A13PP0C7W8 464 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 FAM90A14PP0C7W9 464 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 FAM90A24PP0C7X0 464 aa9.79□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 GTF2F2P13984 249 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 MAP2K4P45985 399 aa9.79□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 SLC22A1O15245 554 aa9.78□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 RPS25P62851 125 aaKnown RBP9.78□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa9.78□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 Q96M66 194 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 GFI1Q99684 422 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP9.78□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 CCDC90BQ9GZT6 254 aa9.78□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 Q9H521 79 aa9.78□□□□□ -0.84
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PRAME-204ENST00000403441 RYR3Q15413 4870 aa9.77□□□□□ -0.84
PRAME-204ENST00000403441 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa9.77□□□□□ -0.85
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PRAME-204ENST00000403441 HES1Q14469 280 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 AWAT2Q6E213 333 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 SIGIRRQ6IA17 410 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 ZNF497Q6ZNH5 498 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 SPARTQ8N0X7 666 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 OR9G1Q8NH87 305 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 S100A13Q99584 98 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 BARHL1Q9BZE3 327 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 ZFP57Q9NU63 452 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 ING3Q9NXR8 418 aa9.77□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 ARL6IP5O75915 188 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-204ENST00000403441 TMEM11P17152 192 aa9.76□□□□□ -0.85
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PRAME-204ENST00000403441 MYCNOSP40205 109 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 GLP1RP43220 463 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 MADCAM1Q13477 382 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 GLT8D1Q68CQ7 371 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 THNSL2Q86YJ6 484 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 COMMD1Q8N668 190 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 C5orf56Q8N8D9 126 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 OR10A7Q8NGE5 316 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 OR56B4Q8NH76 319 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 TMEM203Q969S6 136 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 KIRREL1Q96J84 757 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 SPACA1Q9HBV2 294 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 LRRC42Q9Y546 428 aa9.76□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 MEIKINA0A087WXM9 373 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 TMEM14DPA8MWL7 114 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 SLC17A2O00624 439 aa9.75□□□□□ -0.85
PRAME-204ENST00000403441 HSPB6O14558 160 aa9.75□□□□□ -0.85
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