RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 PNLIPP16233 465 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FUT5Q11128 374 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TMEM211Q6ICI0 200 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RHBDD1Q8TEB9 315 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 VSTM2LQ96N03 204 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 A0A1W2PN81 502 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FCGR3AP08637 254 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 NIT1Q86X76 327 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 Q8IYB0 196 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LYG1Q8N1E2 194 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR2V2Q96R30 315 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IGHEP01854 428 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CRYABP02511 175 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR2I1PQ8NGU4 316 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SAP30LQ9HAJ7 183 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 GCSHP23434 173 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CBLN1P23435 193 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RELBQ01201 579 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 C5orf17Q8NAS9 161 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CADM4Q8NFZ8 388 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 KCNE4Q8WWG9 221 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ADTRPQ96IZ2 230 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SMIM8Q96KF7 97 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SLX1AQ9BQ83 275 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR2W1Q9Y3N9 320 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 NHSQ6T4R5 1651 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IGSF23A1L1A6 192 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LEPROTL1O95214 131 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 S100A4P26447 101 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RIGQ13278 110 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR4F17Q8NGA8 305 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TUBA4BQ9H853 241 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 IL19Q9UHD0 177 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HLA-DQA1P01909 254 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ZNF506Q5JVG8 444 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 NR2C2APQ86WQ0 139 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TMEM56Q96MV1 263 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TOX2Q96NM4 488 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TMEM222Q9H0R3 208 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DPRXA6NFQ7 191 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 LDLRAD4O15165 306 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BKO60814 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 BGLAPP02818 100 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BJP06899 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BOP23527 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BBP33778 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BDP58876 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BCP62807 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST2H2BEQ16778 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR5R1Q8NH85 324 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BHQ93079 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BNQ99877 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 HIST1H2BMQ99879 126 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MIEN1Q9BRT3 115 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 REG4Q9BYZ8 158 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SCN9AQ15858 1988 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 KNTC1P50748 2209 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 F5P12259 2224 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 COLCA2A8K830 154 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 KBTBD11O94819 623 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ALKBH6Q3KRA9 238 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DCAF12Q5T6F0 453 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR1B1Q8NGR6 318 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 GPHA2Q96T91 129 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CHST5Q9GZS9 411 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SRP19P09132 144 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PMELP40967 661 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FXYD3Q14802 87 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RTP5Q14D33 572 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 C1orf100Q5SVJ3 147 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 BIVMQ86UB2 503 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 OR6X1Q8NH79 312 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TAF15Q92804 592 aaKnown RBP eCLIP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 GNRHR2Q96P88 292 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DNAJC13O75165 2243 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SLC22A20A6NK97 555 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 ADRA2AP08913 450 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 FOLR2P14207 255 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 GPX4P36969 197 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 TFPI2P48307 235 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 RABEPKQ7Z6M1 372 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 MOB3AQ96BX8 217 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 PEF1Q9UBV8 284 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 SERGEFQ9UGK8 458 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa8.54□□□□□ -1.04
HERC3-202ENST00000402738 CYR61O00622 381 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.8 ms