RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399253.3

AC234778.1-201, humanhuman

BASIC

Gene AC234778.1, Length 370 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC234778.1-201ENST00000399253 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 CELP19835 753 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 LMO1P25800 156 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 MYCNOSP40205 109 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 SLC35B1P78383 322 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 ASCL4Q6XD76 172 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 PRSS48Q7RTY5 328 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 FOXRED2Q8IWF2 684 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 OR51T1Q8NGJ9 327 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 ORAI1Q96D31 301 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 CYYR1Q96J86 154 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 OR5B12Q96R08 314 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 P2RX4Q99571 388 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 HSPB9Q9BQS6 159 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 ISYNA1Q9NPH2 558 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 IL36GQ9NZH8 169 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 U3KQK5 164 aa6.65□□□□□ -1.34
AC234778.1-201ENST00000399253 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 OOSP1A8MZH6 123 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 SEC14L6B5MCN3 397 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 RGS10O43665 173 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 SERPINA2P20848 420 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 CRHBPP24387 322 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 GPR12P47775 334 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 DOC2BQ14184 412 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 GPR176Q14439 515 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 IL13RA2Q14627 380 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 IRF3Q14653 427 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 RSU1Q15404 277 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 TRAM1Q15629 374 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 NHLRC3Q5JS37 347 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 NKAPLQ5M9Q1 402 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 DDI2Q5TDH0 399 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 PRR18Q8N4B5 295 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ZFP41Q8N8Y5 198 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 Q8NFD4 153 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 NEK7Q8TDX7 302 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 S100A13Q99584 98 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 YTHDF1Q9BYJ9 559 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 METTL9Q9H1A3 318 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 COL7A1Q02388 2944 aa6.64□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 A0A1W2PP11 408 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 FGF16O43320 207 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 IGHG2P01859 326 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 CGB3P0DN86 165 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 CGB7P0DN87 165 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 RANBP1P43487 201 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 KCNJ3P48549 501 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 RAB7AP51149 207 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 GABARAPL2P60520 117 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 MED22Q15528 200 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ZNF260Q3ZCT1 412 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 LINC00596Q86U02 117 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 OR8H3Q8N146 312 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 NKAIN3Q8N8D7 197 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ZNF565Q8N9K5 539 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 Q8N9W7 124 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 OR13C5Q8NGS8 318 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 PHYHIPQ92561 330 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 UFD1Q92890 307 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ARL11Q969Q4 196 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 MRPS24Q96EL2 167 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 CNBD2Q96M20 576 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 DERL3Q96Q80 235 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 OR14A2Q96R54 314 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 UQCC2Q9BRT2 126 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa6.63□□□□□ -1.35
AC234778.1-201ENST00000399253 ING4Q9UNL4 249 aa6.63□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms