RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395727.6

PTPN20-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 20, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPN20, Length 790 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN20-208	ENST00000395727	PAN3	Q58A45	887 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TPTE2P1	Q5T6R2	138 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RSBN1	Q5VWQ0	802 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RNLS	Q5VYX0	342 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RNF144B	Q7Z419	303 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	GAPT	Q8N292	157 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ABHD12	Q8N2K0	398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	DHRSX	Q8N5I4	330 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	NDNF	Q8TB73	568 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TNFAIP8L1	Q8WVP5	186 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM80	Q96HE8	168 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	PGLYRP3	Q96LB9	341 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	MMP28	Q9H239	520 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF286A	Q9HBT8	521 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RCC2	Q9P258	522 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	FOXJ3	Q9UPW0	622 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	HILPDA	Q9Y5L2	63 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM90A10P	A6NDY2	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	EFCAB10	A6NFE3	127 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM90A7P	A6NKC0	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	FAM90A23P	A8MXZ1	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	FGF16	O43320	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	XPNPEP2	O43895	674 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	CA11	O75493	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SC5D	O75845	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	LALBA	P00709	142 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SLPI	P03973	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	GLA	P06280	429 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	EGR2	P11161	476 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	GZMH	P20718	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	C21orf33	P30042	268 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	BDKRB2	P30411	391 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	MNDA	P41218	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	VDAC2	P45880	294 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RAB13	P51153	203 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RIPK1	Q13546	671 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	EBI3	Q14213	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RSU1	Q15404	277 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	OGFRL1	Q5TC84	451 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	DDI2	Q5TDH0	399 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	PRAMEF5	Q5TYX0	476 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	OR2G6	Q5TZ20	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF554	Q86TJ5	538 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	LYPD6	Q86Y78	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	OR8H3	Q8N146	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	OSR2	Q8N2R0	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	LINC00311	Q8N616	119 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	OR13A1	Q8NGR1	328 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	GHSR	Q92847	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	GPER1	Q99527	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	METTL9	Q9H1A3	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TMPRSS5	Q9H3S3	457 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SPACA1	Q9HBV2	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	RAB9B	Q9NP90	201 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	FKBP14	Q9NWM8	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ETAA1	Q9NY74	926 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	CALY	Q9NYX4	217 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	IDI2-AS1	Q9NZ38	188 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	CKLF	Q9UBR5	152 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	KIF25	Q9UIL4	384 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ST3GAL6	Q9Y274	331 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SIGLEC9	Q9Y336	463 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	VWF	P04275	2813 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	MEIKIN	A0A087WXM9	373 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727		A0A1W2PPI3	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	MEX3A	A1L020	520 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	C15orf65	H3BRN8	121 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727		J3QR06	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TOR1A	O14656	332 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	TXNL1	O43396	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ORC5	O43913	435 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	BAG2	O95816	211 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	CLIC3	O95833	236 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	CSTB	P04080	98 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	CALCB	P10092	127 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	GTF2F2	P13984	249 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SLC6A1	P30531	599 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	CAPG	P40121	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	GLP1R	P43220	463 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	OR3A4P	P47883	348 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	SOX2	P48431	317 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	ZNF137P	P52743	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTPN20-208	ENST00000395727	WNT4	P56705	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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