RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395705.3

CTBP2-204, Transcript of C-terminal binding protein 2, human

TSL 3

Gene CTBP2, Length 580 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTBP2-204	ENST00000395705	OR10A3	P58181	314 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	BLCAP	P62952	87 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PRR31	Q5SQ13	230 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR10A7	Q8NGE5	316 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	RBMXL1	Q96E39	390 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	FAAP24	Q9BTP7	215 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TM2D1	Q9BX74	207 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF696	Q9H7X3	374 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PLGRKT	Q9HBL7	147 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	GFOD1	Q9NXC2	390 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAPPC2L	Q9UL33	140 aa		13.44	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A1W2PPI3	338 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SOCS1	O15524	211 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	ORC5	O43913	435 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	HBZ	P02008	142 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	HES5	Q5TA89	166 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CD200R1L	Q6Q8B3	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PRR18	Q8N4B5	295 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR51D1	Q8NGF3	324 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		13.43	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SH2D7	A6NKC9	451 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	MRPS14	O60783	128 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	GLA	P06280	429 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PSMB9	P28065	219 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CEACAM3	P40198	252 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	GNMT	Q14749	295 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	RAB11B	Q15907	218 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705		Q8N2B8	174 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SVOP	Q8N4V2	548 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	C11orf44	Q8N8P7	122 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CFHR4	Q92496	578 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TOMM40L	Q969M1	308 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	RPE	Q96AT9	228 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	PITPNC1	Q9UKF7	332 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	LRRC42	Q9Y546	428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705		A0A0B4J203	849 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TRDV1	A0A1B0GX56	115 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SMIM30	A4D0T7	59 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CCRL2	O00421	344 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TIMM23	O14925	209 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	ARSB	P15848	533 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	REG1B	P48304	166 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF134	P52741	427 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	C2orf76	Q3KRA6	126 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	C22orf42	Q6IC83	251 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF773	Q6PK81	442 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	DRAM1	Q8N682	238 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	ZNF439	Q8NDP4	499 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR52M1	Q8NGK5	317 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR56B4	Q8NH76	319 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CREB3L1	Q96BA8	519 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	HDHD3	Q9BSH5	251 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SLC25A33	Q9BSK2	321 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	YTHDF1	Q9BYJ9	559 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TAF9B	Q9HBM6	251 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705		V9GY05	133 aa		13.41	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM90A9P	A6NNJ1	464 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	AMY1A	P04745	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	AMY2A	P04746	511 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	SNRNP70	P08621	437 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	VSIG10L2	P0DP72	767 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	BRS3	P32247	399 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TMEM50B	P56557	158 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	C6orf183	Q5T699	404 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR2W3	Q7Z3T1	314 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	LINC00311	Q8N616	119 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR52L2P	Q8NGH6	319 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	OR10X1	Q8NGY0	326 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	CAPSL	Q8WWF8	208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		13.4	□□□□□ -0.26
CTBP2-204	ENST00000395705	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	OOSP1	A8MZH6	123 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	HSD17B6	O14756	317 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	SPINT2	O43291	252 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	CA11	O75493	328 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	CT45A1	Q5HYN5	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	CT45A3	Q8NHU0	189 aa		13.39	□□□□□ -0.27
CTBP2-204	ENST00000395705	ST6GALNAC6	Q969X2	333 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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