RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384536.1

RNU6-1241P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1241, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1241P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1241P-201ENST00000384536 YIPF3Q9GZM5 350 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 COMMD5Q9GZQ3 224 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ANKRD19PQ9H560 264 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C11orf1Q9H5F2 150 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 METTL17Q9H7H0 456 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RAB18Q9NP72 206 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TMEM100Q9NV29 134 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MED29Q9NX70 200 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 VAPAQ9P0L0 249 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CFAP45Q9UL16 551 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CHMP2BQ9UQN3 213 aa-2.58□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 A0A087WSZ3 146 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 OR51F1A6NGY5 319 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KLRC4O43908 158 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TGFAP01135 160 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 APOA4P06727 396 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TRGC1P0CF51 173 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RALBP11234 206 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CD79BP40259 229 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PSMB2P49721 201 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RAB4BP61018 213 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PMVKQ15126 192 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CEACAM21Q3KPI0 293 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RPS4Y2Q8TD47 263 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SMCR5Q8TEV8 140 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NELFBQ8WX92 580 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 REEP6Q96HR9 211 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SENP8Q96LD8 212 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 C11orf70Q9BRQ4 267 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 HRASLS2Q9NWW9 162 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MRPL27Q9P0M9 148 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TMEM14CQ9P0S9 112 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 KNSTRNQ9Y448 316 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZGRF1Q86YA3 2104 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SCN3AQ9NY46 2000 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 AKNAQ7Z591 1439 aa-2.59□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.82
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 DNAH5Q8TE73 4624 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FAM170AA1A519 330 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TBCAO75347 108 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 AGTP01019 485 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 REG1AP05451 166 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 UGT2B4P06133 528 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CD7P09564 240 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TNNI3P19429 210 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SFNP31947 248 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 IFNGR2P38484 337 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MAGEA2P43356 314 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GABRA2P47869 451 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FABP6P51161 128 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 EMP1P54849 157 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 UBE2NLQ5JXB2 153 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 OR4P4Q8NGL7 312 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NUBPLQ8TB37 319 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MUCL1Q96DR8 90 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 FAAP24Q9BTP7 215 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NUP58Q9BVL2 599 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SPACA1Q9HBV2 294 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ACTR3BQ9P1U1 418 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PRO0628Q9UI54 55 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TRAV25A0A0B4J276 109 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 METTL21EPA6NDL7 271 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CD300LBA8K4G0 201 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 AKR7A2O43488 359 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 NDUFS5O43920 106 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CECR9P0C854 216 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 RAB4AP20338 218 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GRPRP30550 384 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TSPEAR-AS2P59090 65 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ESPL1Q14674 2120 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PSMD5Q16401 504 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PDZK1Q5T2W1 519 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 OR4K2Q8NGD2 314 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CTNNBL1Q8WYA6 563 aaPredicted RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 VAT1Q99536 393 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TRIM62Q9BVG3 475 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CHST6Q9GZX3 395 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 POLE4Q9NR33 117 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 PEX16Q9Y5Y5 336 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 TLCD2A6NGC4 264 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 ANKRD65E5RJM6 399 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 LINC01619G3V211 115 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1241P-201ENST00000384536 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa-2.62□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms