RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384526.1

RNU6-880P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 880, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-880P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-880P-201ENST00000384526 USF1P22415 310 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATP5DP30049 168 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 GGT2P36268 569 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 NUP62P37198 522 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 AKR1C3P42330 323 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 GRB2P62993 217 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ART3Q13508 389 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 HTR4Q13639 388 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 PDE6HQ13956 83 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM41BQ5BJD5 291 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 LPCAT4Q643R3 524 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 MBOAT2Q6ZWT7 520 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 LHFPL1Q86WI0 220 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 WFDC11Q8NEX6 87 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 BPIFCQ8NFQ6 507 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR5H2Q8NGV7 314 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR5B3Q8NH48 314 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ALS2CR12Q96Q35 445 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 PRSS27Q9BQR3 290 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRIM62Q9BVG3 475 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ULBP1Q9BZM6 244 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CRIPTQ9P021 101 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 PIGLQ9Y2B2 252 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 MTCH2Q9Y6C9 303 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 USP54Q70EL1 1684 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-1.68□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 LY75O60449 1722 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF99A8MXY4 864 aaPredicted RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SMKR1H3BMG3 65 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 PSTPIP1O43586 416 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 POP7O75817 140 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 IFNA1P01562 189 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 HLA-AP01891 365 aaKnown RBP-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SOD3P08294 240 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 MLNP12872 115 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ETS1P14921 441 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SPRR1BP22528 89 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCNOP22674 350 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 AQP5P55064 265 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR2B6P58173 313 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 PRLHP81277 87 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC38A11Q08AI6 406 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM241Q24JQ0 296 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM229BQ4G0N7 80 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CSAG1Q6PB30 78 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 MARCH3Q86UD3 253 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARL10Q8N8L6 244 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 C9orf163Q8N9P6 203 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR8B12Q8NGG6 310 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 NDNFQ8TB73 568 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 UBA3Q8TBC4 463 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC7A13Q8TCU3 470 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 GPER1Q99527 375 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SFXN3Q9BWM7 321 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 PECRQ9BY49 303 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHST5Q9GZS9 411 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ANKRD19PQ9H560 264 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SNURFQ9Y675 71 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 KIAA0556O60303 1618 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SHROOM2Q13796 1616 aa-1.69□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SBNO1A3KN83 1393 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CHD5Q8TDI0 1954 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 DHRS12A0PJE2 317 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 A8MTW9 85 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 PSPHP1O15172 72 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CRXO43186 299 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 C1QBP02746 253 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SERPINA5P05154 406 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 BCKDHBP21953 392 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 GLRA2P23416 452 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CCR2P41597 374 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRDNQ13061 729 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SKP2Q13309 424 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARMC12Q5T9G4 340 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 AGTRAPQ6RW13 159 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 RGS9BPQ6ZS82 235 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 DEFB132Q7Z7B7 95 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 Q86TA4 180 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CBLN2Q8IUK8 224 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM83FQ8NEG4 500 aaPredicted RBP-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR8A1Q8NGG7 326 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR51L1Q8NGJ5 315 aa-1.7□□□□□ -2.68
RNU6-880P-201ENST00000384526 SNF8Q96H20 258 aa-1.7□□□□□ -2.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms