RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 METTL21EPA6NDL7 271 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 IFITM5A6NNB3 132 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 NOTOA8MTQ0 251 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MCRIP1C9JLW8 97 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TOR1AO14656 332 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 AIREO43918 545 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN15O95858 294 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 IGLV1-47P01700 117 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FUT3P21217 361 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 NFYBP25208 207 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CD34P28906 385 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CEACAM3P40198 252 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ARHGDIBP52566 201 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 INSL4Q14641 139 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 HERPUD1Q15011 391 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 C17orf58Q2M2W7 97 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TRAT1Q6PIZ9 186 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 Q6ZTK2 550 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 DTX3Q8N9I9 347 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR13A1Q8NGR1 328 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PLPPR1Q8TBJ4 325 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 NEK7Q8TDX7 302 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PTX4Q96A99 478 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 FAM3DQ96BQ1 224 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 KIRREL1Q96J84 757 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 Q96M66 194 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CENPOQ9BU64 300 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SELENOIQ9C0D9 397 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CALYQ9NYX4 217 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF581Q9P0T4 197 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 DPM3Q9P2X0 92 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RAB22AQ9UL26 194 aa6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 A0A087X0M5 115 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1B0GX30 115 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 LEUTXA8MZ59 168 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 NOL3O60936 208 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PDCD6O75340 191 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MPIG6BO95866 241 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 IL1AP01583 271 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SMIM18P0DKX4 95 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RAB6AP20340 208 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GZMHP20718 246 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GADD45AP24522 165 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 BRS3P32247 399 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SSTR5P35346 364 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PRRX1P54821 245 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-DRB5Q30154 266 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 UTF1Q5T230 341 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ATAD3CQ5T2N8 411 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf183Q5T699 404 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 RAB12Q6IQ22 244 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 GPR141Q7Z602 305 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF554Q86TJ5 538 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 Q8N2B8 174 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf44Q8N8P7 122 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SUMF2Q8NBJ7 301 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MRGPRDQ8TDS7 321 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 CREB3L1Q96BA8 519 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 BCL7BQ9BQE9 202 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 TM2D1Q9BX74 207 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 PRSS22Q9GZN4 317 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MMP28Q9H239 520 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 IDI2-AS1Q9NZ38 188 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 SCOCQ9UIL1 159 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 MGAT4AQ9UM21 535 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 ETV7Q9Y603 341 aa6.15□□□□□ -1.42
SGMS1-201ENST00000361543 COL7A1Q02388 2944 aa6.15□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 A0A1W2PP11 408 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM14DPA8MWL7 114 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 SPINT2O43291 252 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 PEX14O75381 377 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CSF1P09603 554 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CGB3P0DN86 165 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CGB7P0DN87 165 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 VSIG8P0DPA2 414 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 CD24P25063 80 aa6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 VDAC2P45880 294 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
SGMS1-201ENST00000361543 P2RY14Q15391 338 aa6.14□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71 ms