RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331789.9

ACTB-201, Transcript of actin beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTB, Length 1,917 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-201ENST00000331789 HEXAP06865 529 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR4A8P0C604 315 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 GABRA2P47869 451 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ADAM5Q6NVV9 412 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SLC51BQ86UW2 128 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR1S1Q8NH92 325 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 POLEQ07864 2286 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 RPS10-NUDT3A0A1W2PQS6 291 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OOEPA6NGQ2 149 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 BCL2L11O43521 198 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SPDEFO95238 335 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 S100A1P23297 94 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CD80P33681 288 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 GATA4P43694 442 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LUMP51884 338 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CMTM1Q8IZ96 169 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SLC35G3Q8N808 338 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 MRGPRDQ8TDS7 321 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 GCM1Q9NP62 436 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 IL19Q9UHD0 177 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa14.98□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 DYSFO75923 2080 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ZNF737O75373 536 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ASCL1P50553 236 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LY6DQ14210 128 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SSX8Q7RTT4 187 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 FAM90A1Q86YD7 464 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SELENOHQ8IZQ5 122 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 BVESQ8NE79 360 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR13A1Q8NGR1 328 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 FAM210AQ96ND0 272 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 DCTN5Q9BTE1 182 aa14.97□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 DSCAMO60469 2012 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 MSGN1A6NI15 193 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 FAM90A27PA6NNH2 459 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 B3GALNT1O75752 331 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 SCGB1D2O95969 90 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 IGLV2-14P01704 120 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 HBZP02008 142 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 EDDM3AQ14507 147 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 OR52L2PQ8NGH6 319 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TMEM56Q96MV1 263 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 PRORYQ9H606 182 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 ATRXP46100 2492 aa14.96□□□□□ -0.01
ACTB-201ENST00000331789 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 OR8U9P0C7N5 309 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 TNFSF4P23510 183 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 IL2RGP31785 369 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 CLLU1Q5K131 121 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF695Q8IW36 515 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 OR52M1Q8NGK5 317 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 OR8U1Q8NH10 309 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 GALMQ96C23 342 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 GSX2Q9BZM3 304 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 DNTTIP1Q9H147 329 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 RNF7Q9UBF6 113 aa14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 RBM7Q9Y580 266 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 RAI1Q7Z5J4 1906 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 SPTA1P02549 2419 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 MBPP02686 304 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 SRPXP78539 464 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNRF1Q8ND25 227 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 ST8SIA2Q92186 375 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 NEUROG1Q92886 237 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 CHD8Q9HCK8 2581 aa14.95□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 CDS2O95674 445 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 RLN2P04090 185 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 PET100P0DJ07 73 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 UCP1P25874 307 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 RAB14P61106 215 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 UBA52P62987 128 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 GNMTQ14749 295 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 NCMAPQ5T1S8 102 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 OR51H1Q8NH63 302 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 LINC01560Q8TB33 94 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 SCARB1Q8WTV0 552 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 SNX22Q96L94 193 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 ARPC5LQ9BPX5 153 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 NGBQ9NPG2 151 aa14.94□□□□□ -0.02
ACTB-201ENST00000331789 KCNS2Q9ULS6 477 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms