RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 BSPH1Q075Z2 132 aa13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 SPATA46Q5T0L3 261 aa13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 STOML3Q8TAV4 291 aa13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 AQP10Q96PS8 301 aa13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 SYT3Q9BQG1 590 aa13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 PLK3Q9H4B4 646 aa13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 Q9N2K0 584 aa13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
TSNARE1-201ENST00000307180 PLAUP00749 431 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CELA3BP08861 270 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 OR5AC1P0C628 307 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CA6P23280 308 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 DUSP1P28562 367 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 IDH3GP51553 393 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 NAAAQ02083 359 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM219AQ8IW50 185 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 C14orf79Q96F83 325 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 RSRP1Q9BUV0 290 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SUCNR1Q9BXA5 334 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 OBP2BQ9NPH6 170 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC2A9Q9NRM0 540 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FBN2P35556 2912 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 A0A1W2PPR1 153 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LGALS8O00214 317 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP10-9P60411 292 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 NCMAPQ5T1S8 102 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 ATRAIDQ6UW56 229 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FOXRED2Q8IWF2 684 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 BAP18Q8IXM2 172 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF488Q96MN9 340 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 DNTTIP1Q9H147 329 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 OR51I2Q9H344 312 aa13.39□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 PPYP01298 95 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FABP1P07148 127 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SMIM6P0DI80 62 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 TPT1P13693 172 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LOXP28300 417 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 IL24Q13007 206 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 HFEQ30201 348 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 TMEM108Q6UXF1 575 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FBXW12Q6X9E4 464 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LINC00596Q86U02 117 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LRTM2Q8N967 370 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 OR11L1Q8NGX0 322 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 NEK7Q8TDX7 302 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 PKIBQ9C010 78 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CDH20Q9HBT6 801 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 MLXQ9UH92 298 aa13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 TRAV20A0A0B4J274 112 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 IGHV1-18A0A0C4DH31 117 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 J3QW42 95 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CD3EP07766 207 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SCTP09683 121 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CBR1P16152 277 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CD40P25942 277 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 PPP1CBP62140 327 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 Q3ZCU0 254 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 ADAM5Q6NVV9 412 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LIAT1Q6ZQX7 453 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SSX8Q7RTT4 187 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 C5orf24Q7Z6I8 188 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM58AQ8N1B3 248 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SUMF2Q8NBJ7 301 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 GLYATL2Q8WU03 294 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 ZNF251Q9BRH9 671 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LRBAP50851 2863 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 HSPB6O14558 160 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CECR9P0C854 216 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LYZL2Q7Z4W2 148 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 NEUROG1Q92886 237 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 C18orf12Q96KH6 178 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SLC5A7Q9GZV3 580 aa13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP13.37□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 CACNA1DQ01668 2161 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 ABCA4P78363 2273 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM74A7A6NL05 159 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 TRDCB7Z8K6 153 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 H7C1Q1 480 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 ST8SIA5O15466 376 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SMPD2O60906 423 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 DIRAS3O95661 229 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 IGKV3-15P01624 115 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 TK1P04183 234 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 HKR1P10072 659 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 PTAFRP25105 342 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 IL13RA2Q14627 380 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 SMCO1Q147U7 214 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 FAM74A3Q4VXF1 159 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 LGI3Q8N145 548 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 DMBX1Q8NFW5 382 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 NRGNQ92686 78 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 OR2J1Q9GZK6 312 aa13.36□□□□□ -0.27
TSNARE1-201ENST00000307180 RNF115Q9Y4L5 304 aa13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.7 ms