RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297157.7

RP9-201, Transcript of RP9, pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene RP9, Length 1,121 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RP9-201ENST00000297157 FAM89BQ8N5H3 189 aa20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 DTX3Q8N9I9 347 aa20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 FAM46BQ96A09 425 aa20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 CREB3L1Q96BA8 519 aa20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 ZNF702PQ9H963 129 aa20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 HILPDAQ9Y5L2 63 aa20.47■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 FAM172BPA6NC97 362 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 LEUTXA8MZ59 168 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 J3QR06 171 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 F2RL2O00254 374 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 CCRL2O00421 344 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 MPIG6BO95866 241 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 RAB13P51153 203 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 KCTD21Q4G0X4 260 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 OR2W3Q7Z3T1 314 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 REC114Q7Z4M0 266 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 C8orf31Q8N9H6 132 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 RFESDQ8TAC1 157 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 TMEM59Q9BXS4 323 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 MMP28Q9H239 520 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 ETAA1Q9NY74 926 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 PSG11Q9UQ72 335 aa20.46■□□□□ 0.87
RP9-201ENST00000297157 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 OOSP1A8MZH6 123 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 AIPO00170 330 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 LDLRAD4O15165 306 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 PRRX1P54821 245 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 NDNFQ8TB73 568 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 LPAR5Q9H1C0 372 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 KCNK15Q9H427 330 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 SERTAD4Q9NUC0 356 aa20.45■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 A0A0A6YYD4 124 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 VSIG10L2P0DP72 767 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 NFYBP25208 207 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 PSMD7P51665 324 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 Q3ZCU0 254 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 ZNF554Q86TJ5 538 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 V9GY05 133 aa20.44■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 C12orf77C9JDV5 145 aa20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 PLA1AQ53H76 456 aa20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 LINC00311Q8N616 119 aa20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 NEK7Q8TDX7 302 aa20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 ARL11Q969Q4 196 aa20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 NICN1Q9BSH3 213 aa20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 PITPNC1Q9UKF7 332 aa20.43■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 TOR1AO14656 332 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 ARSBP15848 533 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 CEACAM3P40198 252 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 TMEM30BQ3MIR4 351 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 MRPL30Q8TCC3 161 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 CCDC107Q8WV48 283 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 LEAP2Q969E1 77 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 SULT4A1Q9BR01 284 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 ABCB10Q9NRK6 738 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 GFOD1Q9NXC2 390 aa20.42■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 FAM90A9PA6NNJ1 464 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 FBXO24O75426 580 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 P2RY14Q15391 338 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 RAB11BQ15907 218 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 C6orf183Q5T699 404 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 TRAT1Q6PIZ9 186 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 OR4K15Q8NH41 348 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 PLGRKTQ9HBL7 147 aa20.41■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 UBE2QL1A1L167 161 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 NAPSAO96009 420 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 ZNF880Q6PDB4 577 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 NR2C2APQ86WQ0 139 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 LYG1Q8N1E2 194 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 ZNF439Q8NDP4 499 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 OR51D1Q8NGF3 324 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 FAM3DQ96BQ1 224 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 STEAP1Q9UHE8 339 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 TRAPPC2LQ9UL33 140 aa20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP20.4■□□□□ 0.86
RP9-201ENST00000297157 CD28P10747 220 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 PSMB9P28065 219 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 RANBP1P43487 201 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 TMEM50BP56557 158 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 C2orf76Q3KRA6 126 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 C6orf201Q7Z4U5 140 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 NDUFA11Q86Y39 141 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 NEDD4LQ96PU5 975 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 WNT10AQ9GZT5 417 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 HSF4Q9ULV5 492 aa20.39■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa20.38■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 A0A1W2PPI3 338 aa20.38■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 IFITM5A6NNB3 132 aa20.38■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 PDCD5O14737 125 aa20.38■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 IGHV3-7P01780 117 aa20.38■□□□□ 0.85
RP9-201ENST00000297157 HBZP02008 142 aa20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms